一个半自动化的spike sorting软件
可用来处理pclamp获得的数据,或者协助clampfit使用
github地址:https://github.com/CongyueZhang/Semiauto-Spike-Sorting
必读
请严格遵守【文件命名规则】,若文件中含有高电平Trigger信号,请以_
下划线加上刺激后缀,并保证文件名中仅有一个_
。
界面
① Data Path文本输入框:在此处输入期望处理的数据的路径
② Load按键:按下后加加载①中路径下的数据
③ Channel n下拉框:按下②后,读取到的数据通道将会显示在下拉框内
④ View Channel n按键:按下后,将③中选中的Channel中的数据显示在⑬中。
(注:若该通道从未进行处理过,会先进行自动峰电位分类处理)
⑤ Select Cluster按键:按下后,可在⑬中用鼠标拉出红色矩形
⑥ Add new Cluster按键:按下后,会将⑤的红色矩形选中的峰电位添加到新的Cluster中
⑦ Add to Cluster x按键:按下后,会将⑤的红色矩形选中的峰电位添加到⑧中选中的Cluster中
⑧ Cluster x复选框:可单选可多选(按住ctrl后可多选),⑦、⑨和⑩中的一些功能会只对选中的Cluster x进行处理。
⑨ Delete Cluster x按键:按下后,会删除⑧中选中的Cluster
⑩ Function选择框:单选,可以选择期望运行的功能
⑪ Run Function按键:按下后会执行⑩中选择的功能
⑫ 标题:会在此处显示⑬中出现的峰电位的数量
⑬ 图像显示框:峰电位会在此显示
数据的读取
操作
将数据路径粘贴在Data Path
文本框中,点击Load
按键,即可将路径下的原始数据(.abf文件)或往期处理结果(.mat文件)(批量)读取进来。