python横向条形图_seaborn做横向条形图

该博客介绍了如何使用seaborn库在Python中绘制基因表达差异的横向条形图。首先,从文件读取数据并进行排序,然后选取fold值最大的前20个基因。接着,设置了条形图的x轴范围,并过滤出绝对fold变化大于0.58496的数据。最后,绘制了条形图并保存为PNG和PDF格式,显示了不同数据库中基因的log2 Fold Change值。
摘要由CSDN通过智能技术生成

数据格式如下

387e1e8add8912f368e2361a2ff0500b.png

这里选择fold值最大的前20个作图进行展示 代码如下

import seaborn as sns

import pandas as pd

import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

infpkm="gene_diff2019102206.xls"

genename="Aoc1"

picpathname="Aoc1.test"

df = pd.read_csv(infpkm,header=0,sep="\t")

#根据绝对值大小从大到小进行排序

df = df.reindex(df['log2FoldChange'].abs().sort_values(ascending=False).index)

#取前20行

df = df.iloc[:20,:]

#获取最大的fold绝对值作为x轴的上下限

txlim = np.abs(df.loc[:,'log2FoldChange'].tolist()[0])

#获取作图的两列

pre_draw=df[['Datebase_type','log2FoldChange']]

#选择绝对值大于0.58496的数据

pre_draw

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