显示三维图片序列_老司机带你解锁ImageJ三维图像分析

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二维图像分析技能已经Get了，那么三维图像分析呢？

ImageJ(https://imagej.nih.gov/ij/)是美国National Institutes of Health(NIH)开发的基于Java的免费公共图像处理软件，在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。

ImageJ/Fiji是已捆绑了许多常用插件的ImageJ，其下载链接为：http://imagej.net/Fiji/Downloads，可根据操作系统自行选择：

今天给大家分享使用ImageJ/Fiji进行三维图像分析！

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Stack图像介绍

ImageJ可在一个窗口中显示多个空间或时间相关的图像，这些图像集称为图像栈(Stack)，组成Stack的图像称为Slice。Stack图片具备有三个空间维度：X，Y和Z。Hyperstacks具有四个以上维度，例如X(长)，Y(宽)，Z(片)，C(通道)和T(时间帧)。

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ImageJ三维可视化

ImageJ可对Stack图像进行重建来构建三维立体模型，在医学图像中可以将CT层扫图片重建为三维立体模型。共聚焦图片也可以进行Z-Stack层扫获得三维图片。

步骤：

1、ImageJ打开Stack图片pollen60xPCO512.seq，2维图像(XY视图)窗口如左侧窗口(640x 480pixels)，当前Slice为99张图片的第46张，图片属性(Image -> Properties)如右图所示：