研究背景
实验表明,当二价锰取代镁酶活性位点中的镁时,该酶的催化活性通常得以维持。这一观察导致了锰被广泛用作光谱学上活性的镁替代品,因为与镁不同,它是顺磁性的。然而,镁很少是酶中二价锰的催化能力替代品,因为某些酶中的锰作用独特,显然不能被其他金属离子所取代,原因尚不清楚。
研究主旨
本文研究了二价锰、镁和锌在生物学环境下的配位特性,发现锰在结构和功能上可以替代镁,但镁却不能完全替代锰。这主要是由于锰在特定酶中的独特作用机制,以及它对配体的选择性偏好。文章还指出,锰的配位数偏好与镁相似,而锌则表现出更广泛的配位数范围。这些发现有助于理解金属离子在生物系统中的功能差异。
研究特点
二价锰、镁和锌在生物系统中扮演着独特的角色,尽管它们具有许多相似的化学性质。基于晶体结构数据(来自剑桥结构数据库和蛋白质数据库)以及分子轨道和密度泛函计算,对二价锰、镁和锌的配位性质进行了比较。从结构数据库得出的数据分析中确定了二价锰在晶体结构决定中的配位数分布和配体的身份。通过计算研究评估了如水合阳离子失水或水化过程中的焓变和自由能变化。将二价锰的六水合物转化为五水合物,其中一个水分子位于第二配位壳层的能量惩罚介于镁的高值和锌的低值之间。二价锰的首选配位数为六,与镁相同,而锌的首选配位数则不太确定,范围从4到6。