1、软件环境
Neo4j桌面端管理软件版本:1.2.4
安装的数据库版本是Neo4j3.5.17
2、数据库的交换
在项目中创建出数据库名称及数据库版本,会生成对应的数据库文件databases,可以通过粗暴地替换该数据库文件实现数据库的交换。(一台机器一般只能同时运行一个数据库)
3、本体文件转换成Neo4j文件
3.1、安装与导入
OWL文件导入Neo4j 4.1.3:
https://blog.csdn.net/wsj_518/article/details/110236557
官方教程(很清楚):
https://neo4j.com/labs/neosemantics/4.0/import/
这个博客写的很详细,注意:
1、安装neosemantics (n10s)时,要注意与Neo4j图数据库版本保持一致,可以直接在Neo4j客户端进行插件安装。
https://github.com/neo4j-labs/neosemantics/tree/4.3
2、导入命令中的本地文件地址字符串形式,例如
初始化配置
CREATE CONSTRAINT n10s_unique_uri ON (r:Resource) ASSERT r.uri IS UNIQUE
call n10s.graphconfig.init()
call n10s.rdf.import.fetch( "file:///D:/pythonproject/RDB2OWL/data/newOWL.ttl","Turtle")
也可以是其他格式,例如官方教程给出的Turtle, N-Triples, JSON-LD, RDF/XML, TriG and N-Quads
call n10s.rdf.import.fetch( "file:///D:/pythonproject/RDB2OWL/data/newOWL.rdf","RDF/XML")
本体文件的格式,可以直接使用protege进行另存。
3.2、导入到Neo4j的效果分析
使用n10s将本体文件导入到Neo4j时,会将本体文件中自带概念、属性一并导入进来,在本体中自定义的类、数据属性和关系属性等都被添加了ns0前缀,但是数据属性的值没有被加前缀,
3.2、导入后的n10s的前缀处理
将中文开放知识图谱的owl文件导入到neo4j中,踩坑总结
https://blog.csdn.net/qq_43071444/article/details/121200748
OWL/RDF导入neo4j前缀消除,踩坑总结
https://blog.csdn.net/yaminne/article/details/118768139
采用的是match(n) where n.uri=~"http://www.kgtest.com#.*" set n.uri=substring(n.uri,22) return n
CQL语句。
去除节点的uri属性值的http前缀
match(n) where n.uri=~"http://www.semanticweb.org/kert/ontologies/2022/6/BMMOntology#.*" set n.uri=substring(n.uri,62) return n
typesToLabels: false,//生成实例与类相连,无类别 ,经过n10s 4.3.0.0版本的测试,没有实现 生成实例与类相连
call n10s.rdf.import.fetch( "file:///D:/pythonproject/RDB2OWL/data/importNeo4j/BMMOntology_reasoning.owl","RDF/XML",{typesToLabels:false})
此处还提供一份python代码用于批量去除图数据库中的标签标签、关系、属性字段中的ns0__前缀
# -*- coding: utf-8 -*-
# @Time : 2022-09-01 19:46
# @Author : 山南君
# @Function : 使用python和原生Cypher语句操作Neo4j图数据,主要是为了修改 本体经n10s转存到Neo4j的图数据库标签、关系、属性字段中的ns0__前缀。使用的是官方的neo4j-driver 4.4.6
# @History :
# @Software: PyCharm
from neo4j import GraphDatabase
class CQLHelper:
def __init__(self):
self.uri = "neo4j://localhost:7687"
self.driver = GraphDatabase.driver(self.uri, auth=("neo4j", "123456"))
def RunCQLstrs(self,CQLstrPath):
'''
从txt文件中按行读取多条CQL命令进行循环执行
Args:
CQLstrPath: CQL命令所在txt文件路径
Returns:
'''
CQLstrs = [i.strip() for i in open(CQLstrPath, encoding='utf-8') if i.strip()]
for cql in CQLstrs:
if len(cql)!=0:
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql)
print(res.data())
def updateRelation(self):
cql1="MATCH ()-[r]->() RETURN r "
relations=[]
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql1)
for dt in res.data():
relation=dt['r'][1]
if relation not in relations:
relations.append(relation) #将所有的关系放在一个list中
#将关系名中的ns0__前缀删除
for relation in relations:
newRelation=str.replace(relation,"ns0__","")
cql2 = "match(n)-[r:{0}]->(m) create(n)-[r2:{1}]->(m) set r2=r with r delete r".format(relation,newRelation)
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql2)
print(res.data())
def updateLabelAndProperty(self):
cql1="Match (n) return labels(n) AS label"
labels=[]
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql1)
for li in res.data():
label=li['label']
labels=labels+label
labels=list(set(labels)) #对标签进行去重
print(labels)
#修改标签名,去除标签名中的ns0__ 前缀
for lab in labels:
if "ns0__" in lab:
newlab = str.replace(lab, "ns0__", "")
cqlstr=''' MATCH (n:`{0}`) REMOVE n:`{0}` SET n:`{1}` '''.format(lab,newlab)
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cqlstr)
print("标签:", lab, "新标签:", newlab)
print("图数据库中的所有标签集合:",labels)
print("所有标签已经修改完成,或者没有要修改的标签")
#按标签类型获取每个标签类型的字段属性集合
for lab in labels:
props = []
cql2 = r"MATCH (n:`{0}`) WITH n UNWIND keys(n) as key RETURN distinct key".format(lab)
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql2)
for i in res.data():
if i not in props:
props.append(i['key'])
print("标签:", lab, "对应的属性集合:", props)
#按标签名依次去除该标签名的属性名中的 ns0__ 前缀
for key in props:
if "ns0__" in key:
newKey=str.replace(key,"ns0__","")
cql3 = "match(n:`{0}`) set n.`{1}`=n.`{2}` remove n.`{2}`".format(lab,newKey,key)
with self.driver.session() as session:
res = session.run(cql3)
print("标签:", lab, "属性:", key,"新属性:",newKey)
print("所有标签的所有属性已经修改完成,或者没有要修改的属性")
if __name__ == '__main__':
helper=CQLHelper()
path="CQLStrings.txt"
helper.updateLabelAndProperty()
9、其他拓展资料
1、如何在一台机器上同时运行多个图数据库
https://blog.csdn.net/ljp1919/article/details/103170995
2、neo4j属性无法写入的字符
https://blog.csdn.net/for_yayun/article/details/121148849
由于Neo4j不支持特殊字符,如 - []
等,但是支持下划线和小数点_ .
,所以使用n10s时导入本体时,就要求本体中不可以包含一些特殊字符。如果本体中包括特殊字符,n10s就会报错。