量子化学仿真软件：ORCA_（25）.案例研究：大分子与复杂系统计算

最新推荐文章于 2025-03-23 09:55:17 发布
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分类专栏： 分子动力学仿真 文章标签： 仿真模拟 模拟仿真 分子动力学
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42749425/article/details/146289859
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案例研究：大分子与复杂系统计算

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1. 大分子体系的输入文件生成

在处理大分子和复杂系统时，生成正确的输入文件是至关重要的第一步。ORCA软件提供了灵活的输入文件格式，可以处理从简单的单分子体系到复杂的多分子体系。本节将详细介绍如何生成大分子体系的输入文件，并通过具体例子进行说明。

1.1 输入文件结构

ORCA的输入文件通常以.inp或.in为扩展名，文件中包含多个部分，每个部分以关键字开头。基本结构如下：


                

                
                
        

        

    

  


        

            

                

                

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量子化学仿真软件：ORCA_（11）.高级计算类型：溶剂效应计算

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-22
					
					790
					
				

			

		

		

			
				
ORCA 提供了多种方法来模拟溶剂效应，包括隐式溶剂模型（如 COSMO、PCM）和显式溶剂模型（如分子动力学模拟）。在量子化学计算中，溶剂效应的考虑是非常重要的，特别是在处理溶液相中的化学反应和性质时。ORCA 提供了多种方法来模拟溶剂效应，包括隐式溶剂模型（如COSMO、PCM）和显式溶剂模型（如分子动力学模拟）。对于光谱性质的计算，可以使用 TD-DFT 方法结合隐式溶剂模型（如 COSMO）来模拟溶剂对光谱的影响。在进行溶剂效应优化计算时，可以通过指定溶剂模型来考虑溶剂对分子几何构型的影响。

			
		

	



                

            
              



	

		

			

				
					
gaussian 初步 input file 的编写

				
			

			

				

					hahahaki的博客
				

				

					09-16
					
					968
					
				

			

		

		

			
				
input file basic form
usually to calculate HOMO and LUMO, we first optimize the structure and then we calculate the energy（单点能），which includes the kinetic and potential energy of the electrons.
To calulate the optimaze structure
%nprocshared=2
%mem=300MW
%

			
		

	



              


  
              

                


	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（24）.案例研究：小分子计算

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-16
					
					785
					
				

			

		

		

			
				
通过以上案例，我们可以看到ORCA在小分子量子化学计算中的强大功能。从简单的单点能量计算到复杂的溶剂化效应和反应路径模拟，ORCA都能提供高效且准确的计算结果。使用Python脚本生成输入文件和分析输出文件，可以大大提高计算的自动化程度和效率。希望这些示例能帮助读者更好地理解和应用ORCA进行量子化学计算。

			
		

	





	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（20）.活性与反应机理研究

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-23
					
					808
					
				

			

		

		

			
				
通过使用ORCA进行活性与反应机理的研究，可以深入了解化学反应的各个步骤和中间体的性质。过渡态的搜索、反应路径的优化、反应能垒的计算以及频率分析是研究反应机理的基本方法。此外，基组优化、溶剂效应计算和多级理论方法可以进一步提高计算的准确性和效率。希望本节的内容能对您的研究有所帮助。

			
		

	



		

			
		



	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（12）.高级计算类型：非绝热过程模拟

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-23
					
					700
					
				

			

		

		

			
				
在MCTDH方法中，多态波函数通常表示为多个电子态的线性组合。

			
		

	





	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（16）.性能优化技巧

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-23
					
					577
					
				

			

		

		

			
				
编写自定义脚本可以自动化计算流程，减少人为错误，提高计算效率。以下是一个简单的Python脚本示例，用于批量生成ORCA输入文件。性能优化是提高量子化学仿真软件计算效率的关键环节。通过并行计算、内存管理、输入文件优化和计算方法选择等手段，可以显著提高计算速度和减少资源消耗。此外，高级优化技巧如使用高效算法、预计算和缓存、选择合适的电子结构包和优化几何构型，也可以进一步提升计算性能。希望这些技巧能帮助你在使用ORCA进行二次开发时，更好地应对大规模计算任务，节省时间和成本。

			
		

	





	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（12）.ORCA与其他软件的接口

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-15
					
					913
					
				

			

		

		

			
				
通过文件转换、脚本编写和插件扩展，ORCA软件可以方便地与其他量子化学软件进行接口对接，实现数据的无缝交换和复杂工作流程的自动化。这些接口不仅提高了数据处理的效率，还增强了ORCA的适用性和灵活性，使其成为量子化学研究中的重要工具。

			
		

	





	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（2）.ORCA软件安装与配置

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-15
					
					1089
					
				

			

		

		

			
				
ORCA支持通过编写自定义脚本来扩展其功能。以下是一个示例的自定义脚本，用于批量处理多个输入文件。/bin/bash # 获取输入文件目录 input_dir = "/path/to/input/files" # 获取输出文件目录 output_dir = "/path/to/output/files" # 遍历输入文件目录中的所有.inp文件 for file in $input_dir /*.inp;

			
		

	





	

		

			

				
					
量子化学仿真软件：ORCA_（5）.基本计算类型：能量计算

				
			

			

				

					kkchenjj的博客
				

				

					03-15
					
					638
					
				

			

		

		

			
				
通过能量计算，我们可以获得分子的总能量、基态能量、激发态能量等关键信息。几何优化是能量计算的一个扩展，它旨在找到分子的最低能量构型。通过几何优化，我们可以获得分子的平衡几何结构，这对于后续的计算（如频率计算、反应路径计算等）非常重要。单点能量计算是最简单的能量计算类型，它主要用于计算一个给定的分子几何构型下的总能量。频率计算主要用于确定分子的振动模式和频率，以及验证几何优化结果的稳定性。之后的几行描述了分子的几何构型，其中 C 和 H 分别表示碳和氢原子，后面的三个数字分别表示 x、y 和 z 坐标。

			
		

	





	

		

			

				
					
spring-boot-autoconfigure-2.5.9.jar中文-英文对照文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文-英文对照文档
jar包下载地址
Maven依赖
Gradle依赖
源代码下载地址

# 本文件关键字：

jar中文-英文对照文档.zip,java,jar包,Maven,第三方jar包,组件,开源组件,第三方组件,Gradle,中文API文档,手册,开发手册,使用手册,参考手册

# 使用方法：
解压最外层zip，再解压其中的zip包，双击 【index.html】 文件，即可用浏览器打开、进行查看。

# 特殊说明：
·本文档为人性化翻译，精心制作，请放心使用。
·只翻译了该翻译的内容，如：注释、说明、描述、用法讲解 等；
·不该翻译的内容保持原样，如：类名、方法名、包名、类型、关键字、代码 等。

# 温馨提示：
（1）为了防止解压后路径太长导致浏览器无法打开，推荐在解压时选择“解压到当前文件夹”（放心，自带文件夹，文件不会散落一地）；
（2）有时，一套Java组件会有多个jar，所以在下载前，请仔细阅读本篇描述，以确保这就是你需要的文件；

			
		

	





	

		

			

				
					
tools.nrepl-0.2.0.jar中文-英文对照文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文-英文对照文档
jar包下载地址
Maven依赖
Gradle依赖
源代码下载地址

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（1）为了防止解压后路径太长导致浏览器无法打开，推荐在解压时选择“解压到当前文件夹”（放心，自带文件夹，文件不会散落一地）；
（2）有时，一套Java组件会有多个jar，所以在下载前，请仔细阅读本篇描述，以确保这就是你需要的文件；

			
		

	





	

		

			

				
					
validation-api-1.0.0.GA.jar中文-英文对照文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文-英文对照文档
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Maven依赖
Gradle依赖
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非线性多智能体有向网络一致性的最小领导者数分配研究与应用

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
内容概要：本文探讨了非线性多智能体有向网络中最小领导者数的分配问题及其重要性。文中通过具体的例子如无人机编队飞行，解释了不同网络拓扑结构（如环状、树状、星型）下选择适当数量和位置的领导节点对于确保系统一致性和稳定性的作用。同时介绍了相关数学模型和算法，如利用拉普拉斯矩阵判断系统的可控性，以及通过数值模拟展示领导节点位置对收敛速度的影响。此外还讨论了增加领导数量可能带来的负面影响，并提出了一种基于状态机管理的混合自适应协议来增强系统的鲁棒性。
适合人群：从事分布式系统、自动化控制、机器人技术等领域研究的专业人士和技术爱好者。
使用场景及目标：适用于需要优化多智能体协作效率的实际工程项目，如无人机群控、自动驾驶车队管理等，旨在提高系统的响应速度、稳定性和资源利用率。
其他说明：文章不仅提供了理论依据，还包括了具体的代码实现示例，便于读者理解和实践。


			
		

	





	

		

			

				
					
websocket-common-9.4.11.v20180605.jar中文文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文文档
jar包下载地址
Maven依赖
Gradle依赖
源代码下载地址

# 本文件关键字：

jar中文文档.zip,java,jar包,Maven,第三方jar包,组件,开源组件,第三方组件,Gradle,中文API文档,手册,开发手册,使用手册,参考手册

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javacpp-1.5.5.jar中文文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文文档
jar包下载地址
Maven依赖
Gradle依赖
源代码下载地址

# 本文件关键字：

jar中文文档.zip,java,jar包,Maven,第三方jar包,组件,开源组件,第三方组件,Gradle,中文API文档,手册,开发手册,使用手册,参考手册

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spring-boot-autoconfigure-2.4.0.jar中文-英文对照文档.zip

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
# 压缩文件中包含：
中文-英文对照文档
jar包下载地址
Maven依赖
Gradle依赖
源代码下载地址

# 本文件关键字：

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微电网运行控制与Simulink仿真实现：拓扑结构、运行方式及优化技巧

					
最新发布

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
内容概要：本文详细介绍了微电网运行控制及其在Simulink平台上的仿真实现方法。首先，文章描述了一个风光储混合系统的具体构建，包括光伏阵列、风力发电机以及储能系统的配置。接着，重点讲解了公共连接点(PCC)处的自动切换机制，特别是针对电压波动的响应策略。文中还探讨了储能系统的下垂控制算法，用于实现功率的有效分配，并指出初始固定下垂系数导致的问题及解决方案。此外，文章讨论了运行模式切换时的预同步处理，强调了相位检测的重要性。最后，作者分享了一些仿真过程中获得的经验，如选择合适的潮流计算算法可以显著提高仿真效率。
适合人群：对微电网研究感兴趣的科研人员、电力系统工程师和技术爱好者。
使用场景及目标：①理解和掌握微电网的基本组成和运行原理；②学习如何利用Simulink进行微电网建模和仿真；③获取关于优化仿真性能的实际经验。
阅读建议：由于涉及到较多的技术细节和专业术语，建议读者具备一定的电气工程背景知识，在阅读过程中注意结合提供的代码片段进行深入理解。


			
		

	





	

		

			

				
					
表贴式永磁同步电机非线性磁链观测器无感仿真技术及应用

				
			

			

				

					05-11
				

			

		

		

			
				
内容概要：本文详细介绍了表贴式永磁同步电机采用非线性磁链观测器的无感仿真技术。这种技术能够在初始位置确定后直接启动电机，无需高频信号注入，从而显著减少启动电流并提高低速区的性能。文中还讨论了非线性磁链观测器的设计、无感控制策略以及仿真参数与实际电机控制器的高度对应性。通过该技术，可以在汽车工业等领域大幅提升电机的控制精度和响应速度。
适合人群：从事电机控制领域的研究人员和技术人员，尤其是对永磁同步电机无感控制感兴趣的读者。
使用场景及目标：适用于需要优化电机启动性能和低速区控制精度的场合，如电动汽车、工业自动化等。目标是提高电机的效率、降低能耗并改善系统响应速度。
阅读建议：读者可以通过本文深入了解非线性磁链观测器的工作原理及其在实际应用中的优势，结合具体的案例分析来掌握这一先进技术。


			
		

	





	

		

			

				
					

				
			

			

				

					
				

			

		

		

			
				

			
		

	



              




          




        



    





    



      

      

        
      

      





	

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成就一亿技术人!

          

          

        

        

          

          

            领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝
            规则
          

        

      

      

        

          

            
              
            
            

              
hope_wisdom
 发出的红包
            

          

        

        

          

          

          

        

      

    

    

  





	
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