服务器指令学习记录-----ska暑期训练

写在前面的话

经过这次ska暑期训练，两三天的时间做个小小的科研项目，感觉学了很多东西，分门别类的记录一下吧。

登入服务器

ssh -Y 服务器的域名，输入密码即可登录（-Y是因为有些图形窗口需要弹窗）

进去之后sinfo可以查看各个cpu的情况

三种提交作业的方式

我们要在服务器上跑一个指令，我们需要用提交作业的方式去提交，让服务器给我们分配资源跑这个指令

1. sbatch -w purley-x86-cpu03 cotter.sh --datadir=/o9000/YNU_Course/acct29 --obsnum=1077910616 --tres=4 --fres=40

-w为指定你的cpu，并且后面可以–参量，给cotter.sh这个脚本传递一个外部的参量。如datadir后面的四个参量都是外部参量。

之后可以使用
squeue （-n，-p，-u）分别以（节点，cpu，用户）的方式去查看任务的方式去查看，如果user_st显示为r就是正在运行，没有任务就是已经结束了。

2. srun -N 1 -n 1 -p all-x86-cpu python test.py
   -N, --nodes 使用节点数
   -n, --ntasks 任务数或使用进程数
   -c, --cpus-per-task 每个任务使用cpu核数
   –ntasks-per-node 每节点任务数

3. salloc -N 1 -n 1 -p all-x86-cpu -t 2:00:00 (请求占用节点资源)
   squeue -u username (查询占用资源情况)
   ssh nodename (进入占用节点)
   exit (退出占用节点)
   exit (结束占用节点)
   进入占用节点之后就可以当成自己电脑使用了，记得最后要退出节点。

4. 附录：
   我们可以用vim在服务器上写一个脚本但是记得第一行要加一行

#!/bin/bash 

加载环境或者工具包

服务器很多包和环境基本上自己手动加载的，以下面为例子。

module avail   #查看该系统可用的包

第一行是包所在的文件夹

下面是包的版本

module use /home/app/modulefiles    #引用环境
module load ds9/centos7-v8.0           #引用包

记得登录时候ssh -Y 不然会报错

把服务器的东西下载到本地电脑

一般小的文件下载倒是没啥问题，不过天文的文件都挺大的，尽量在服务器上操作吧。

rsync -a -e ssh deep_image ska03@113.55.127.180:.   下载到云大服务器
rsync -a -e ssh ska03@113.55.127.180:deep_image .   下载到本地  在自己电脑的文件夹上面

最后的小点特别注意，其实就是当前路径的意思，服务器地址之后要接：才能接路径且不需要加/

最后exit可以退出服务器

如果使用windos的话可以使用scp -r 语法都是一样的。