Numba加速Python教程

以下内容来自官网教程：http://numba.pydata.org/numba-doc/latest/user/5minguide.html

Numba介绍

Numba是Python的即时编译器，在使用NumPy数组和函数以及循环的代码上效果最佳。 使用Numba的最常见方法是通过其装饰器集合，这些装饰器可应用于您的函数以指示Numba对其进行编译。 调用带有Numba装饰的函数时，该函数将被“即时”编译为机器代码以执行，并且您的全部或部分代码随后可以本机机器速度运行！

Numba可运行环境

• 系统: Windows (32 and 64 bit), OSX and Linux (32 and 64 bit)
• 架构：x86，x86_64，ppc64le。在armv7l，armv8l（aarch64）上进行实验。
• GPU：Nvidia CUDA。在AMD ROC上进行实验。
• CPython
• NumPy 1.15-最新

Numba安装

conda install numba或者是pip install numba

Numba通常用作核心软件包，因此其依赖关系保持在绝对最低限度，但是，可以按如下所示安装其他软件包以提供其他功能：

• scipy-支持编译numpy.linalg函数。
• colorama-支持在回溯/错误消息中突出显示颜色。
• pyyaml-通过YAML配置文件启用Numba的配置。
• icc_rt-允许使用Intel SVML（高性能短向量数学库，仅x86_64）。安装说明在性能提示中。

安装方法：

pip install scipy
pip install colorama
pip install PyYAML
pip install icc-rt

Numba教程

Numba简单示例

Numba是否高效取决于代码，如果代码是数字定向的（做大量的数学运算），使用NumPy很多和/或有很多循环，那么Numba通常是一个不错的选择。

Numba在如下所示的代码上运行良好

from numba import jit
import numpy as np

x = np.arange(100).reshape(10, 10)

@jit(nopython=True) # Set "nopython" mode for best performance, equivalent to @njit
def go_fast(a): # Function is compiled to machine code when called the first time
    trace = 0
    for i in range(a.shape[0]):   # Numba likes loops
        trace += np.tanh(a[i, i]) # Numba likes NumPy functions
    return a + trace              # Numba likes NumPy broadcasting

print(go_fast(x))

如果是这样的话，它将无法很好地工作：请注意**，Numba无法理解Pandas**，因此Numba只需通过解释器运行此代码，但会增加Numba内部开销！

from numba import jit
import pandas as pd

x = {'a': [1, 2, 3], 'b': [20, 30, 40]}

@jit
def use_pandas(a): # Function will not benefit from Numba jit
    df = pd.DataFrame.from_dict(a) # Numba doesn't know about pd.DataFrame
    df += 1                        # Numba doesn't understand what this is
    return df.cov()                # or this!

print(use_pandas(x))

Numba装饰器

Numba有很多装饰器，我们已经看到了@jit，但是还有：
一些装饰器中可用的其他选项：

ctypes/cffi/cython 互操作性:

Numba理解

什么是nopython模式？

Numba @jit装饰器基本上在两种编译模式下运行，即nopython模式和对象模式。

在上面的go_fast示例中，在@jit装饰器中设置了nopython = True，这指示Numba在nopython模式下运行。 nopython编译模式的行为是实质上编译装饰后的函数，以便其完全运行而无需Python解释器的参与。 这是使用Numba jit装饰器的推荐和最佳实践方法，因为它可以带来最佳性能。

如果nopython模式下的编译失败，Numba可以使用对象模式进行编译，如果未设置nopython = True，则这是@jit装饰器的后备模式（如上述use_pandas示例所示）。 在这种模式下，Numba将识别可以编译的循环并将其编译为在机器代码中运行的函数，并在解释器中运行其余代码。 为了获得最佳性能，请避免使用此模式！

如何衡量Numba的性能？

首先，回想一下，Numba必须在执行函数的机器代码版本之前针对给定的参数类型编译函数。 但是，一旦编译完成，Numba会为呈现的特定类型的参数缓存函数的机器代码版本。 如果使用相同类型再次调用，则它可以重用缓存的版本，而不必再次编译。

衡量性能时，一个真正常见的错误是不考虑上述行为，并使用一个简单的计时器对代码进行一次计时，该计时器包括在执行时间中编译函数所花费的时间。

衡量Numba JIT对您的代码的影响的一种好方法是使用timeit模块函数对执行时间进行计时，这些函数测量执行的多次迭代，因此可以适应第一次执行时的编译时间。

附带说明一下，如果需要考虑编译时间，则Numba JIT支持在磁盘上缓存已编译函数，并且还具有“提前”编译模式

Numba可以多快

假设Numba可以在nopython模式下运行，或者至少编译一些循环，它将把编译目标对准您的特定CPU。 加速因应用而异，但可以是一到两个数量级。 Numba的性能指南涵盖了获得额外性能的常见选项。

Numba如何工作

Numba读取装饰函数的Python字节码，并将其与有关函数输入参数类型的信息结合起来。 它分析和优化您的代码，最后使用LLVM编译器库生成针对您的CPU功能量身定制的函数的机器代码版本。 每次调用函数时，都会使用此编译版本。