linux上在自己的目录下安装miniconda3

本文介绍了在Linux服务器上安装miniconda3的详细过程,包括为何选择miniconda3、如何下载安装、解决conda初始化问题以及设置国内镜像加速。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在QC后,我发现下载的数据,GC含量都是双峰的,这肯定是要进行过滤的。

于是我跟着jimmy大神的教程进行过滤,使用的是trim_galore软件。

但是!服务器上没有现成的软件可以使用,而且这个是需要依赖于cutadapt和fastqc两个软件依托才可以安装使用的

我首先尝试源代码安装cutadapt

cutadapt下载源代码:https://github.com/marcelm/cutadapt

1、conda 安装成功;但调用的时候一直出问题,也找不到原因,于是换成源码安装(捂脸。。)

2、尝试源码安装:

          git clone https://github.com/marcelm/cutadapt/

          cd cutadapt

          chmod 777 setup.py

          python setup.py 

然后就是遇到各种Python(报错)



作者:笺牒九州的怪咖
链接:https://www.jianshu.com/p/95badba1d7f5
来源:简书
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。

报错后,我发现大部分教程,都是使用conda安装的,于是我进行miniconda3安装

官网下载软件后&

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