nii文件处理
无宠不惊过一生
这个作者很懒,什么都没留下…
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批量nii文件转换为png图像
之前介绍过单个nii文件转换成png图像:https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89501865这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。import numpy as npimport os #遍历文件夹import ...原创 2019-04-26 21:17:08 · 15587 阅读 · 45 评论 -
批量nii文件转换成png格式(用于处理胰腺数据)
这篇博客代码在胰腺数据中可以用,但是用于ADNI数据保存的图像都是噪声,不能用。下面的链接是用于ADNI数据集的代码,个人觉得还是下面链接中的代码稍微好用些,因为不会报错:https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759from PIL import Imageimport numpy as npimpo...原创 2019-04-27 08:55:07 · 3142 阅读 · 3 评论 -
python文件追踪(可用于ADNI数据集将多个文件夹下的nii改名后保存)
写这篇文件追踪的原因主要是:下载了ADNI数据集后,nii文件是在5个文件夹下,不能直接用nii转png的代码(代码见下面链接),所以需要先将nii文件保存到同一个文件夹下。批量nii转png:https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759同时要将nii文件改名(下载下来的nii文件名字比较长):比如都改成0...原创 2019-04-27 09:25:45 · 988 阅读 · 1 评论 -
nii图像保存成png格式(Ubuntu+python)
这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法:https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759系统:Ubuntu 16.04软件: python 3.5先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。import nibabel ...原创 2019-04-24 20:26:44 · 5561 阅读 · 9 评论 -
读取nii或nii.gz文件中的信息即输出图像
读取nii或者nii.gz文件中的信息,并且输出图像。import matplotlibfrom matplotlib import pylab as pltimport nibabel as nibfrom nibabel.viewers import OrthoSlicer3Dfile = '' #你的nii或者nii.gz文件路径img = nib.load(file...原创 2019-06-12 15:31:48 · 11809 阅读 · 7 评论