这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。
这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法:
https://blog.csdn.net/weixin_43330946/article/details/89576759
系统:Ubuntu 16.04
软件: python 3.5
先用pip安装nibabel、numpy、imageio、os。
import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
def read_niifile(niifile): #读取niifile文件
img = nib.load(niifile) #下载niifile文件(其实是提取文件)
img_fdata = img.get_fdata() #获取niifile数据
return img_fdata
def save_fig(file): #保存为图片
fdata = read_niifile(file) #调用上面的函数,获得数据
(x,y,z) = fdata.shape #获得数据shape信息:(长,宽,维度-切片数量)
for k in range(z):
silce = fdata[k,:,:] #三个位置表示三个不同角度的切片
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'