color pathway 使用指南 : 在通路图中标记基因

对于通路分析结果的可视化而言，最常用的展现方式就是在通路中高亮显示富集到的基因。kegg 提供了在Color Pathway 在线服务，可以方便的完成这一任务。

网址如下：

http://www.kegg.jp/kegg/tool/map_pathway3.html

这个工具使用比较简单，分为4步：

1. 在Select KEGG pathway map 输入框中输入想要标记的pathway ID ;

2. 在Enter data中输入需要标记的基因和对应的信息，或者通过选择文件按钮，上传对应的文件；

3. 在Option中选择和上一步输入的文件格式相匹配的操作；

4. 点击Exec按钮，提交任务；

从上面的截图可以看出，这个工具提供了3种标记方式 ，下面我们以hsa05200这条通路为例，看下实际用法

用指定颜色标记基因

输入文件的格式如下：
第一列为需要标记的基因或者KO，其他列为对应的前景色和背景色，背景色简单理解就是方框的填充色，前景色就是边框和文字的颜色。
每一列之间用\t分隔，指定颜色的时候，可