Gene Ontology-基因产物功能数据库

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Gene Ontology, 中文名叫做基因本体论，采用GO terms描述基因产物的功能， 并且提供了不同GO terms 之间的关系。官网如下

http://geneontology.org/

GO定义的基因功能分成以下3大类别：

1. molecular function

2. cellular component

3. biological process

所有GO term构成了一个有向无环图，示意图如下

每个GO是图中的一个节点，GO之间的连线表示图中的边的信息。不同GO之间的箭头是有方向的，代表特殊含义的，所以构成的网状结构叫做有向无环图。

需要注意的是，GO之间的关系不是一个树状结构，首先BP，CC, MF 这3个节点是独立的，没有公共父节点的；其次，GO没有树状结构中严格的层级关系。所有也有父节点，子节点的概念，但是层级关系不明显，一个GO可以有多个父节点。

每个GO term用一个唯一的GO编号表示，前缀为GO, 后面是6位数字，比如GO:0015749。由于GO是基于已有的生物学知识构建的，而这些认知是不断修正和完善的，所有会存在有的GO term被删除了，或者是和其他GO Term合并的情况。

不同GO term之间的关系