Epifactors:表观因子数据库

Epifactors数据库汇总了DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传标记相关的蛋白信息,扩展了传统核心蛋白的网络结构。数据库包含表观因子的基因、蛋白、产物和复合体的详细注释,并提供多种检索方式,如Genes、Complexes、Histones and Protamines。此外,还展示因子的功能分类、细胞及组织表达量数据。该资源对表观遗传研究者极具价值。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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对于DNA甲基化,组蛋白修饰,染色质重塑等表观遗传标记分子的研究迅猛发展,在相关领域已经积累了大量的认知。通过对研究表明的参与这些表观遗传机制的蛋白对应的基因,功能进行整理和归纳,构建了Epifactors数据库,网址如下

http://epifactors.autosome.ru/

为了提供更加全面和丰富的认知,在传统的直接参与表观遗传的蛋白的基础上,定义了表观因子这个概念,将直接参与表观遗传的核心蛋白和其周边蛋白联系起来,进一步丰富了表观遗传中相关分子的网络结构。

将以下几种蛋白定义为表观因子

  1. Proteins acting as histones, histone variants or protamines;

  2. Proteins performing post-translational modifications of histones or recognizing such modifications (histone modification ‘writers’, ‘erasers’ or ‘readers’);

  3. Proteins changing the general structure of chromatin (performing chromatin remodeling), including Proteins that move, eject or restructure nucleosomes (ATP-dependent chromatin remodelers) and proteins that incorporate histone variants into the nucleosomes.

  4. Proteins assist

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