webgestalt:基因富集分析的在线工具

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在组学数据分析中，基因富集分析是最常用的方法之一，所有的基因数据分析最终都要落实到功能上去，富集分析作为一种最基础的功能研究方法，通过go, kegg pathway等不同的基因功能注释数据库，再结合对应的富集分析算法，可以探究输入的基因富集在哪些功能上。

富集分析的必要性和重要性不言而喻，有很多的成熟的软件可以来进行这样的分析，比如clusterProfiler, GSEA等等，然而这些工具的使用还是具备一定的门槛，对于没有编程经验的生物学家而言通过这些软件得到富集分析的结果并不是一件容易的事情。

为了方便广大科研工作者进行富集分析，有很多的在线工具被开发出来，其操作简便，更易上手，最著名的当属DAVID这个网站了，有接近4000次的引用。然而该网站数据更新并不及时，在现在看来，其数据库版本过于老旧，而且不支持一些新出的功能注释数据库。

webgestalt是一个专注于富集分析的在线网站，支持多种富集分析算法，而且涵盖的功能注释数据库较为全面，在今年5月份刚刚升级了版本，对数据库进行了更新。对应的文章发表在Nucleic Acids Research上，链接如下

https://academic.oup.com/nar/article/47/W1/W199/5494758

网址如下

http://www.webgestalt.org

支持12个物种，324种基因ID格式，功能注释不仅包括了常见的go,kegg, 还涵盖了蛋白质相互作用&#x