Imaris 的Surface工具Contour, masking, artificial dissection

该教程介绍了如何使用Imaris软件进行信号与背景的区分,通过Surface功能结合Automatic阈值设定来筛选信号,并运用Masking功能仅展示Surface内的信号。此外,还讲解了删除channel的方法以及Contour功能的应用,如在无法自动区分的情况下进行手动表面创建,以实现特定区域的展示。
摘要由CSDN通过智能技术生成

内容来源Imaris bilibili官方教程
实际上看一遍记不住,需要用的时候再来看Imaris能不能实现,如果能,再去看视频

区分信号与背景

在这里插入图片描述
Step1: 创建一个surface.如果有感兴趣区域可以勾选
在这里插入图片描述
Step2:点击上个图的右下角蓝色小按钮,进入第二步。
先选择要查看的通道。
在这里插入图片描述
然后可以使用Surface Detail值筛选大于Surface detail的信号(数值根据Slice界面大致测量球的直径)。
在这里插入图片描述
Absolute threshold或者local 确定筛选方法。

Step3:不勾选Volume,可以展示此渲染结果
在这里插入图片描述
可以Automatic选择阈值

Step4: 前三步调好阈值后,第四步可以再从筛选到的物体中选择。在这里插入图片描述
可以调两侧来确定阈值。
完成后,Finish,还可以调展示模式
在这里插入图片描述

Masking 功能

Edit功能
在这里插入图片描述
可以实现只展示Surface里边有的信号
Step1:在这里插入图片描述
实现结果:在这里插入图片描述
还可以在建好Surface之后再进行Filter[Filter数值来自旁边的Statistics按钮】

实现下图效果【视频27:20】

在这里插入图片描述
创建surface后,选择还要展示的图像,注意Duplicate复制保存
然后使用最后一个小图标中的插件
在这里插入图片描述

删除channel的方法

Edit—>Delete channels–>勾选不想要的channel删除

Contour功能

在这里插入图片描述
比如只有一种信号无法区分前景和背景;比如无法自动区分脑区,只能手动划分定义。需要进行手动surface
对于无法自动划分的,要选择 Skip automatic creation
在这里插入图片描述

实现只展示某个部分的surface

在这里插入图片描述

还能与其他的一起展示

在这里插入图片描述

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值