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RSS订阅原创 在Rstudio中选择conda虚拟环境 以及查看R版本
之前看的几篇文章直接给出了图2，但我作为新手甚至找不到哪里打开图2。所以贴下详细位置。系统：windows10。
2023-06-08 20:37:26
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原创 R语言报错：could not find function “last“
跑DLCAnalyzer代码的时候，出现了报错：could not find function “last”
2023-06-08 20:19:28
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原创 Imaris 的Surface工具Contour, masking, artificial dissection
内容来源Imaris bilibili官方教程实际上看一遍记不住，需要用的时候再来看Imaris能不能实现，如果能，再去看视频文章目录区分信号与背景Masking 功能实现下图效果【视频27：20】删除channel的方法Contour功能实现只展示某个部分的surface还能与其他的一起展示区分信号与背景Step1: 创建一个surface.如果有感兴趣区域可以勾选Step2：点击上个图的右下角蓝色小按钮，进入第二步。先选择要查看的通道。然后可以使用Surface Detail值筛选大
2022-05-31 10:56:29
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原创 Imaris 不同通道\切面\模式作图展示
以下内容为 Imaris哔哩哔哩官方账号教学视频的学习笔记。节约内存，仅供学习。本视频可以实现的效果图包括示例1示例2：示例3：示例4：Ortho Slicer展示一个层面Slice Position可以调整图的位置；Slice Orientation可以调整图的方向Extended Section调节厚度，可以显示某个区段的信号（注意要取消勾选Volume可以只显示这个区段的信号）对不同部分赋予不同的伪彩【视频8:00】以达到下面这样的效果要先使用 Surface
2022-05-30 22:25:16
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原创 Imaris导入数据和初步使用
以下内容为Importing data into Imaris and the basics of image visualization._哔哩哔哩_bilibili的学习笔记，仅记录方便查看。节约存储空间所以写在这里哈哈哈视频功能目录转化为Imaris格式旋转 和 拖动显示不同通道对比度展示模式标尺设定是否显示导入tif序列图像为3DSlice 模式下，可以进行一些测量提取channel [视频27：00分]对于Imaris无法识别的格式，可以借助FIJISection模式下查看裁剪下采样调整标尺的
2022-05-30 20:30:28
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原创 Fiji/ImageJ调整图像的对比度；Fiji/Image查看图像的像素直方图分布
很多ImageJ/Fiji的问题用中文查不到，尽早尝试用英文去搜索！！！！！！！！下面记录两个小功能，以及英文教程和imageJ写脚本的教程。调整图像对比度Step1：打开一张图像。比如我的一个tif图特别暗，就可以调一调对比度Step2:调整对比度使用快捷键：Ctrl+Shift+C或者：Image—>Adjust —>Brightness/Contrast得到下面这个调节框，然后一般点击Auto就可以了，也可手调查看图像的像素直方图分布Step1:打开一张图像
2022-05-29 22:25:29
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原创 Latex大作业排版记录
这两天用latex写大作业，几个月没用，只能边查边写，回顾记录一部分方便下次使用。导言区用到的包\documentclass{article}\usepackage{geometry}\usepackage{float}\usepackage{ctex}%在命令行输入 texdoc ctex 获得ctex文档 texdoc lshort-zh 获得latex2e帮助文件\usepackage{verbatimbox}\usepackage{graphicx}\usepackage{su
2021-12-17 11:34:05
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原创 打卡Datawhale31期Task04
卷积神经网络CNNDatawhale31期CNN学习资料以下内容基本出自以上学习资料。只记录一些之前不太理解的内容。卷积对于卷积的理解。相当于一个滤波器，可以提取信号中的特征。使用不同的卷积核会得到不同类型的特征。为什么说左边的滤波器就提取到了低频信息，右图滤波器提取到高频信息呢？【1/3，1/3，1/3】滤波器给每一个信号相同的权重，当输入信号都为1时（即没有变化），得到的输出结果就是1，最大。所以更容易提取到变化小的低频信息。【1，-2，1】滤波器给相邻信号相反的权重，当出现中间值为负
2021-11-27 20:52:27
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原创 打卡Datawhale31期Task03
前馈神经网络神经元模型M-P模型：美国神经生理学家沃伦·麦卡洛克( Warren McCulloch ) 和数学家沃尔特 ·皮茨(Walter Pitts )对生物神经元进行建模，首次提出了一种形式神经元模型M-P模型。在M-P模型中，神经元接受其他n个神经元的输入信号(0或1) ，这些信号经过权重加权并求和，将求和结果与阈值比较，然后经过激活函数处理，得到输出。感知器：单层感知器Roseblatt提出了感知器，与M-P模型相比，感知器能够通过训练自动确定参数。训练更新参数公式：wi←wi
2021-11-23 10:07:09
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原创 打卡Datawhale31期Task02
Task02机器学习基础机器学习机器学习可以分为有监督、无监督 和 强化学习常见数据集MNIST、CIFAR10、CIFAR100等常用数据集可以使用pytorch、tensorflow等导入。比如使用CIFAR10数据聚集import torchvision.transforms as transformsimport torchvisiontrain_dataset = torchvision.datasets.CIFAR10(root=r'./data/', tr
2021-11-18 22:30:57
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原创 打卡Datawhale31期Task01
Task1主要学习绪论概述 和 数学基础两个部分。学习资料点这里因为目的在于提升代码能力，所以看完理论把其中一些内容用代码记录出来。（用jupyternotebook导出md,然后导入体验不错hhhh）import numpy as npimport torch矩阵基本知识1.随机数生成一个矩阵# 生成【0,10）之间，4*4的矩阵 A = np.random.randint(0,10,size = (4,4))Aarray([[5, 3, 0, 1], [0,
2021-11-16 19:52:45
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原创 coggle11月打卡-Linux基础
各种犯错过程忘了截图，重来一遍记录。昨晚做的，今早有些步骤就忘记了，hhhh任务一：使用命令行登录指定的Linux环境windows系统，所以我首先下载Putty。然后安装运行（在cmd中输入putty，就会出现下图界面）。根据这个Putty使用介绍，在运行Putty后的Host处输入IP：139.198.15.157。然后点击open。在接下来的界面输入账号：coggle ，密码：coggle。成功进入任务二：在目录下创建文件夹，删除文件夹步骤三、四：在/home/cog
2021-11-05 14:53:35
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原创 如何使用Sklearn.KFold和Split,生成训练和验证集？
使用Sklearn 进行K折交叉验证，代码咋写呢开始正文先导入需要的库import pandas as pdimport numpy as npfrom sklearn.model_selection import KFold读入数据，可以用 pd.read_csv(‘路径名’)。这里就假设数据。假设有5个训练样本x，各对应着一个标签y.下面代码的y_train是numpy.ndarray 类型，为了使用列表进行索引方便。y_train = np.array([1,0,1,1,0]
2021-10-21 21:27:22
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原创 jupyter notebook 个人常用快捷键（一段时间不用就忘记）
调整界面大小使它变大： Ctrl + "+"使它变小： Ctrl + "-"进入“命令模式”按 Esc可以看到 cell 变成了蓝色进入 写代码模式按 Enter可以看到cell变成了绿色在当前cell 上方插入空cell在命令模式下，按 “A”在当前cell 上方插入空cell在命令模式下，按 “B”拆分一个cell把光标放在想分开的位置，然后按下Ctrl + Shift + "减号-"合并一个cell命令模式（蓝色cell）状态下.
2021-10-21 20:52:33
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原创 课程作业1-数据预处理以及 python对函数求导
谨记第一次作业用到的内容，应该是对的吧哈哈哈读取数据，获取基本信息。1. 现已使用Pandas读取数据集challenge.csv• 请提取该数据集的字段名称，将结果存为cols• 请获取给数据的字段和样本数量，将结果分别存为col_num和sam_num• 请获取该数据集的前五行记录，将最后的DataFrame存为five_data开始答题：import pandas as pdtitanic = pd.read_csv("challenge.csv")# 获取字段名称col
2021-09-27 20:56:53
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原创 latex排版好物总结，提升效率
1.在线填表格转化为latex表格一个在线工具: Tables Generator【使用过程中，有的命令在Tex Studio 2019有报错，但可以解决】2.latex公式与word互相转化软件 AxMath评价：好用，个别命令在Tex Studio2019编译报错，查一查可解决。3.将公式截图转化为latex公式mathpix【每个账号50次免费截图转化机会】评价：相当好用，强烈安利4. 按照latex语法写入word文档Aurora【一个插件，下载完安装自动在
2021-05-20 09:41:36
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原创 latex中longtable环境下内容过宽，超出页面
解决longtable环境下内容过宽的问题前言解决longtable环境下内容过宽的问题法1：缩小字体二级目录三级目录碎碎念前言按照惯例，我需要废话引入，为啥要记下这个问题的解决过程？解决方案不易找查找解决方案耗时长前天可能用了不止一个小时试解决方案，基本都是CSDN的博客，但是试了对我不合适。换了个搜索引擎看的第二个博客就解决了我的问题？！大概这就是检索无能吧。解决longtable环境下内容过宽的问题先放上一个长表格的示意，以下为主体\usepackage{longtable}\b
2021-05-10 08:46:13
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原创 swc神经元数据的使用和Python分析
目录回顾如何快速查看swc数据？如何python读取数据？三级目录为啥这么多废话？回顾承接之前的文章: SWC格式文件读取与处理，有了新进展，遂记录下来。（不然真的容易忘）如何快速查看swc数据？今天发现使用”记事本“可以查看。鼠标右键swc格式文件，选择”打开方式“，找到”记事本"，查看成功，如下图为一个例子。接下来根据数据特点可以进一步处理。【想去年我还下载了个AI CC2018软件来查看SWC数据，哈哈哈哈】如何python读取数据？之前的文章有介绍方法: SWC格式文件读取与处理。但是
2021-03-29 21:49:34
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原创 卸载手机模拟大师MobileEmuMaster!!!
因为家里孩子打开或下载某游戏软件，电脑莫名其妙下载了这个手机模拟大师，占内存还是好的，弹窗广告真是忍无可忍！！我删除一些文件夹多次，但它的一些内容会自动再更新。现在有时间，终于找到一举删除的方法。步骤打开任务管理器。Ctrl+Shift+Esc 打开任务管理器（或者通过任务栏右键打开任务管理器）。找到安装文件所在的位置 。找到正在运行的手机模拟大师（MobileEmuMaster)，右键打开文件所在位置.找到”uninst.exe"。返回第二步打开位置的上一层，找到一个黑色的小图标“uninst
2021-03-03 19:19:59
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原创 Python复习
Python复习Pycharm快捷键光标放在一个方法上，Ctrl+ Q 出现帮助窗口，显示具体信息Shift+F10 运行TODO注释 在 # 注释的**#空格**之后增加TODO ，示例：# TODO （小王）显示欢迎界面修改变量名：右键点击一个变量名->Refactor->Rename->在红框中修改变量名即可改变所有或Shift+F6Ctrl+/ 给选中内容注释基础知识模块名也是标识符，起名以字母或下划线开头。Pyc文件：C是编
2021-02-18 10:23:43
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原创 SWC格式文件读取与处理
前情上一篇用现成软件可视化了swc格式的神经元，但是没找到进一步分析的方法。读取因为最终还是打算用python进行分析，所以不断搜索如何用python读取swc格式文件，山穷水复疑无路时，尝试出可以用read_csv命令直接读取文件。真没想到这么简单！！！import pandas as pddata = pd.read_csv("D:/101711-1_3-of-16_initial.CNG.swc",header = None)#datadf = pd.DataFrame(data)
2021-02-10 23:00:45
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原创 Java基础 复习
Java基础 复习以下内容来自于视频学习的笔记: 狂神说Java.IDEA 快捷键Ctrl+Alt+L 自动对齐代码Ctrl + D 复制当前行到下一行Alt+Enter 自动排错，没有的包可以自动导入Ctrl+鼠标点击方法，可以跳转Alt+Insert 自动生成构造器,get，set方法Ctrl+H 光标在某个类里时，使用快捷键，右侧会生成类树Ctrl+Alt+T 在需要包裹的代码处，可以选择包裹方式，比如生成try catch注释单行注释 //多行注释 /* */
2021-02-04 18:19:24
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原创 neuromorpho中SWC数据可视化
数据下载课题设计神经纤维分析，了解到这个网站可以下载一些神经元数据。neuromorpho官网数据使用从上面网站下载到了swc格式的神经元重建数据，但对数据使用不了解，且能查到的资料较少。现在终于找到了SWC格式数据可视化方法，记录下来，以免小菜鸡转头就忘记了。下载Cvapp，以及详细使用方式介绍本人简要总结：从上边下载压缩文件到本地，然后解压在命令行中进入解压后文件位置，如下, 在命令行继续输入下图红线内容，就可以如图所示输出了这条语句中 examples\dCH-cobalt.
2021-01-27 14:20:34
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原创 初用Typora,Markdown语法学习
今天开始使用Typora，方便记录需要代码的笔记，学习下Markdown语法，可以高效地记笔记写博客~标题井号+空格+标题内容，井号个数指明标题级别这里举例 # 一级标题 ## 二级标题 ### 三级标题 ,Typora中最多六级标题字体粗体： Hello的前后各加两个星号，则得到 Hello斜体：Hello的前后各加一个星号，则得到 Hello粗体并且斜体：Hello前后各加三个星号，则得到 Hello文字删除线：Hello前后各加两个~~ 则得到 Hello引用使用 大于号
2021-01-18 23:30:25
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原创 报错：Extension GL_VERSION_1_2 could not be loaded.
1.起因： 想要运行某论文提供的开源软件Sparse Tracer，软件用C++和Qt实现。之前没学过C++，按照User Guide安装运行，报错如下In …\vtk-5.8.0\Rendering\vtkOpenGLExtensionManager.cxx, line 393 vtkOpenGLExtensionManager (0000000003D8A690): Extension GL_VERSION_1_2 could not be loaded.2.解决：通过搜索，找到一个解决方案，从我
2021-01-16 21:07:45
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