scRNA-seq
文章平均质量分 91
人生似_碗酒
有志于解决scRNA-seq和Spatial transcriptomics的数据质量问题
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Spanve:一种检测大规模空间转录组学数据中空间变异基因的有效统计方法
提出了Spanve(空间邻域可变表达基因),这是一种基于统计的方法,用于从空间转录组学数据中检测空间依赖性表达基因,通过将空间和表达的依赖性建模为两个分布的距离,该方法具有较高的计算效率和准确性。Spanve能够输入空间转录组并改进空间组织区域的识别。原创 2023-03-03 17:12:43 · 237 阅读 · 0 评论 -
imputation-综述文章:关于网络推理的scRNA序列插补工具基准突出了高稀疏性水平下的性能缺陷
这是一篇关于插补后scRNA-seq数据是否带来假阳性的讨论性质文章,对目前的几种基于不同原理的插补scRNA-seq算法进行了仿真数据集的测试,同时作者提出插补后数据集本身的生物edge被破坏,插补带来的评价指标提升是虚假edge。 这个设定是很吸引人的。原创 2022-10-19 18:03:39 · 469 阅读 · 0 评论