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原创 Mac选购-国行,港版,日版区别
想到马上又要到Apple开学季了 ,准备购买Apple设备的大学生(准大学生和大学生)都有在暑期(7-9月)购买Apple系列产品的想法,在开学季活动前(主要不知道今年暑期教育优惠会不会有别的活动)下面仅以正常的不同版本的 Apple教育优惠和非教育优惠价格进行统计说明选择电脑是刚刚发布的 15英寸 macbook Air 16 + 1TB版本。
2023-06-23 15:39:29
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原创 Pycharm连接远程服务器的Conda环境的R编程使用 Rwrapper文件 libR.so文件丢失找回
远程服务器上的conda环境里面的 R 能否在本地的Pycharm Professional上直接使用
2023-03-20 16:41:21
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原创 Pycharm连接远程服务器和配置编译器-无法同步package-Module not found问题
Pycharm连接远程服务器和配置编译器-无法同步package-Module not found问题
2023-03-18 18:06:46
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原创 空间分辨率转录组学数据中的归因方法的性能比较评估
空间分辨率的转录组学技术通过提供RNA表达模式及其空间信息引起了人们的极大关注。尽管改进后的技术正在迅速发展,但由于捕获率低,提供空间整体转录组水平剖面的技术仍存在缺失问题。缺失数据的代入是消除这一技术问题的策略之一。我们评估了五种现有方法(SpaGE、stPlus、gimVI、Tangram和stLearn)的归因性能,这些方法被认为能够对空间分辨率转录组数据集的缺失进行预测。评估是通过预测值与原始值的对比进行定性,并通过皮尔逊相关系数、余弦相似度、均方根对数误差、剪影指数和Carinski Harab
2023-03-04 23:04:42
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原创 Spanve:一种检测大规模空间转录组学数据中空间变异基因的有效统计方法
提出了Spanve(空间邻域可变表达基因),这是一种基于统计的方法,用于从空间转录组学数据中检测空间依赖性表达基因,通过将空间和表达的依赖性建模为两个分布的距离,该方法具有较高的计算效率和准确性。Spanve能够输入空间转录组并改进空间组织区域的识别。
2023-03-03 17:12:43
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原创 imputation-综述文章:关于网络推理的scRNA序列插补工具基准突出了高稀疏性水平下的性能缺陷
这是一篇关于插补后scRNA-seq数据是否带来假阳性的讨论性质文章,对目前的几种基于不同原理的插补scRNA-seq算法进行了仿真数据集的测试,同时作者提出插补后数据集本身的生物edge被破坏,插补带来的评价指标提升是虚假edge。这个设定是很吸引人的。
2022-10-19 18:03:39
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原创 imputation文献-A systematic evaluation of single-cell RNA-sequencing imputation methods
该篇综述讨论了基于scRNA-seq设计的多种impuatation方法在差异表达分析和聚类以及轨迹分析等下游分析中的作用,论证了不同方法对于不同数据集的适用性。
2022-10-16 20:13:12
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原创 imputation-文献:False signals induced by single-cell imputation(scRNA-seq插补引入的假阳性问题)
本文是一篇各类scRNA-seq插补工具引入假阳性问题的探讨和统计,作者引入了 仿真数据集和构造的真实数据集,以及引入了新的可重复性指标,来说明插补中存在的普遍的假阳性提升问题。通过基因间关联性和差异表达基因变化来检测假阳性。
2022-10-10 23:04:47
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原创 Python3中Super函数的使用
Python3中Super函数的使用Super函数用法代码演示Super函数用法主要用于调用父类函数代码演示class A: def __init__(self): self.n = 2 print('此时执行A的自定义函数,self的n值为',self.n) def add(self, m): print('self is {0} @A.add'.format(self)) print('执行A的add函数前N值为
2021-07-26 13:17:39
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原创 Linux系统下追加记录到文件中的实例代码解读
Linux系统下追加记录到文件中遇到问题参数声明遇到问题今日阅读Linux程序设计第四版,找到一个使用mmap函数的实例该程序主要定义一个结构体,随后利用mmap,msync以及munmap函数对其进行内容追加,定位以及修改内容的操作。先自己实现该代码,随后进行编译#include <unistd.h>#include <stdio.h>#include <stdlib.h>#include <sys/mman.h>#include
2021-07-21 17:12:17
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原创 在Linux中实现打印目录程序遇到问题及解决
在Linux中实现打印目录程序今日阅读Linux程序设计第四版时,书中给出了一段实例代码,功能为实现/home目录下各级目录结构,当然不一定非得是/home下目录才可以,任何一级目录都可以。自己尝试在Ubuntu系统运行编译,实现效果如下:自己对该程序各行代码进行一个解读分析,同时查阅各项资料:首先定义打印目录的函数void printdir(char *dir ,int depth)char *dir代表DIR目录名,int depth设置当前目录打印后所占空格位置接下来定义函数内需要
2021-07-20 17:31:23
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原创 在Ubuntu19.04系统中安装Emacs遇到的问题
安装显示部分依赖软件包现在无法安装发现emacs26无法安装后来查阅资料,发现在Ubuntu18版本及以上就不需要更新了即不需要以下操作:sudo apt update同时安装也需要将emacs26替换为emacs26-nox即sudo apt-get install emacs26-nox安装程序就不会报错安装后使用emacs --version...
2021-07-19 15:09:10
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原创 2021-07-19 尝试在Ubuntu中安装Emacs遇到的问题
在Ubuntu系统中更新源文件显示仓库已经不再含有Release文件的处理出现具体问题出现具体问题今日学习安装emacs在Ubuntu19.04当中安装详见下方帖子:链接: 如何在Ubuntu中安装Emacs.安装遇到问题,即sudo add-apt-repository ppa:kelleyk/emacs该步骤运行发现报错:该错误显示需要一个新的下载源,老下载源内Release文件已经过期,我的第一反应是更换下载源,换成清华或者阿里从网上搜索开始换源,具体方法操作如下:Ubuntu
2021-07-19 14:40:41
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空空如也
在Ubuntu系统下使用plotroc.py文件画ROC曲线遇到了问题
2021-02-21
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