一 算法优化
解决两个质心距离太近导致局部最优解的情况
k-means算法小结
特别容易陷入到局部最优解
优点:
- 使用欧氏距离进行计算,原理简单(靠近中心点),实现容易
- 聚类效果中上(依赖K的选择),选择不当会造成局部最优解
- 空间复杂度o(N),时间复杂度o(IKN)
N为样本点个数,K为中心点个数,I为迭代次数
缺点:
- 对离群点,噪声敏感 (中心点易偏移)
- 很难发现大小差别很大的簇及进行增量计算
- 结果不一定是全局最优,只能保证局部最优(与K的个数及初值选取有关)
1 Canopy算法配合初始聚类
通过绘制同心圆,进行K值的筛选
需要确定同心圆的半径k1,k2
Canopy + KMeans
目的:使得初始点的选择更加合理
1.1 Canopy算法配合初始聚类实现流程
从左到右,从上到下,直到所有点都被包含进去结束
1.2 Canopy算法的优缺点
优点:
- Kmeans对噪声抗干扰较弱,通过Canopy对比,将较小的NumPoint的Cluster直接去掉有利于抗干扰。
- Canopy选择出来的每个Canopy的centerPoint作为K会更精确。
- 只是针对每个Canopy的内做Kmeans聚类,减少相似计算的数量。
缺点:
- 算法中 T1、T2的确定问题 ,依旧可能落入局部最优解
2 K-means++
通过距离平方进行求解,保证最后算到的质心到当前质心距离最远
选择质心为2,共16个样本点,上图分母为质心到其他各点的距离平方之和,现用15代替,可将15看做x,1为点2到点1的距离平方
选取以上最大值对应的点作为下一个质心
kmeans++目的,让选择的质心尽可能的分散
如下图中,如果第一个质心选择在圆心,那么最优可能选择到的下一个点在P(A)这个区域(根据颜色进行划分)
3 二分k-means
通过误差平方和设置阈值,然后进行划分
实现流程:
- 所有点作为一个簇
- 将该簇一分为二
- 选择能最大限度降低聚类代价函数(也就是误差平方和)的簇划分为两个簇。
- 以此进行下去,直到簇的数目等于用户给定的数目k为止。
设阈值为0.3,大于0.3继续划分,小于停止,如下图
隐含的一个原则
因为聚类的误差平方和能够衡量聚类性能,该值越小表示数据点越接近于他们的质心,聚类效果就越好。所以需要对误差平方和最大的簇进行再一次划分,因为误差平方和越大,表示该簇聚类效果越不好,越有可能是多个簇被当成了一个簇,所以 首先需要对这个簇进行划分。
二分K均值算法可以加速K-means算法的执行速度,因为它的相似度计算少了并且不受初始化问题的影响,因为这里不存在随机点的选取,且每一步都保证了误差最小
4 k-medoids(k-中心聚类算法)
通过从当前点选择中心点(质心)进行判断
K-medoids和K-means是有区别的,不一样的地方在于中心点的选取
- K-means中,将中心点取为当前cluster中所有数据点的平均值,对异常点很敏感!
- K-medoids中,将从当前cluster 中选取到其他所有(当前cluster中的)点的距离之和最小的点作为中心点。
算法流程:
( 1 )总体n个样本点中任意选取k个点作为medoids
( 2 )按照与medoids最近的原则,将剩余的n-k个点分配到当前最佳的medoids代表的类中
( 3 )对于第i个类中除对应medoids点外的所有其他点,按顺序计算当其为新的medoids时,代价函数的值,遍历所有可能,选取代价函数最小时对应的点作为新的medoids
( 4 )重复2-3的过程,直到所有的medoids点不再发生变化或已达到设定的最大迭代次数
( 5 )产出最终确定的k个类
k-medoids对噪声鲁棒性好。
例:当一个cluster样本点只有少数几个,如(1,1)(1,2)(2,1)(1000,1000)。其中(1000,1000)是噪声。如果按照k-means质心会处在(251,251),这显然不是 想要的。这时k-medoids就可以避免这种情况,他会在(1,1)(1,2)(2,1)(1000,1000)中选出一个样本点使cluster的绝对误差最小,计算可知一定会在前三个点中选取,达到消除噪声的目的。
k-medoids只能对小样本起作用,样本大,速度就太慢了,当样本多的时候,少数几个噪音对k-means的质心影响也没有想象中的那么重,所以k-means的应用明显比k-medoids多。
5 Kernel k-means
将低维难划分的数据映射到高维空间中进行划分
kernel k-means实际上就是将难处理的数据集中的每个样本投射到高维空间的处理,然后再将处理后的数据使用普通的k-means算法思想进行聚类。
6 ISODATA
可以对K值大小进行改变
类别数目随着聚类过程而变化;
对类别数会进行合并,分裂
- “合并”:当聚类结果某一类中样本数太少,或两个类间的距离太近时
- “分裂”:当聚类结果中某一类的类内方差太大,将该类进行分裂
7 Mini Batch K-Means
从大量点中选取少量点进行计算,为防止偶然性,重复几次,选取最终的质心
适合大数据的聚类算法
大数据量是什么量级,通常当样本量大于1万做聚类时,就需要考虑选用Mini Batch K-Means算法。
Mini Batch KMeans使用了Mini Batch(分批处理)的方法对数据点之间的距离进行计算。
Mini Batch计算过程中不必使用所有的数据样本,而是从不同类别的样本中抽取一部分样本来代表各自类型进行计算。由于计算样本量少,所以会相应的减少运行时间,但另一方面抽样也必然会带来准确度的下降。
该算法的迭代步骤有两步:
(1)从数据集中随机抽取一些数据形成小批量,把他们分配给最近的质心
(2)更新质心
与Kmeans相比,数据的更新在每一个小的样本集上。对于每一个小批量,通过计算平均值得到更新质心,并把小批量里的数据分配给该质心,随着迭代次数的增加,这些质心的变化是逐渐减小的,直到质心稳定或者达到指定的迭代次数,停止计算。
8 总结
优化方法 | 思路 |
---|---|
Canopy+kmeans | Canopy粗聚类配合kmeans |
kmeans++ | 距离越远越容易成为新的质心 |
二分k-means | 拆除SSE最大的簇 |
k-medoids | 和kmeans选取中心点的方式不同 |
kernel kmeans | 映射到高维空间 |
ISODATA | 动态聚类 |
Mini-batch K-Means | 大数据集分批聚类 |
二 特征降维
1 降维
1.1 定义
降维是指在某些限定条件下,降低随机变量(特征)个数,得到一组“不相关”主变量的过程
-
降低随机变量的个数
-
相关特征(correlated feature)
- 相对湿度与降雨量之间的相关
- 等等
正是因为在进行训练的时候, 都是使用特征进行学习。如果特征本身存在问题或者特征之间相关性较强,对于算法学习预测会影响较大
1.2 降维的两种方式
- 特征选择
- 主成分分析(可以理解一种特征提取的方式)
2 特征选择
2.1 定义
数据中包含冗余或无关变量(或称特征、属性、指标等),旨在从原有特征中找出主要特征。
2.2 方法
- Filter(过滤式):主要探究特征本身特点、特征与特征和目标值之间关联
- 方差选择法:低方差特征过滤
- 相关系数
- Embedded (嵌入式):算法自动选择特征(特征与目标值之间的关联)
- 决策树:信息熵、信息增益
- 正则化:L1、L2
- 深度学习:卷积等
2.3 低方差特征过滤
删除低方差的一些特征,前面讲过方差的意义。再结合方差的大小来考虑这个方式的角度。
- 特征方差小:某个特征大多样本的值比较相近
- 特征方差大:某个特征很多样本的值都有差别
2.3.1 API
sklearn.feature_selection.VarianceThreshold(threshold = 0.0)
删除所有低方差特征
Variance.fit_transform(X)
X:numpy array格式的数据[n_samples,n_features]
返回值:训练集差异低于threshold的特征将被删除。默认值是保留所有非零方差特征,即删除所有样本中具有相同值的特征。
2.3.2 数据计算
对某些股票的指标特征之间进行一个筛选,除去’index,‘date’,'return’列不考虑**(这些类型不匹配,也不是所需要指标)**
总特征如下
pe_ratio,pb_ratio,market_cap,return_on_asset_net_profit,du_return_on_equity,ev,earnings_per_share,revenue,total_expense
index,pe_ratio,pb_ratio,market_cap,return_on_asset_net_profit,du_return_on_equity,ev,earnings_per_share,revenue,total_expense,date,return
0,000001.XSHE,5.9572,1.1818,85252550922.0,0.8008,14.9403,1211444855670.0,2.01,20701401000.0,10882540000.0,2012-01-31,0.027657228229937388
1,000002.XSHE,7.0289,1.588,84113358168.0,1.6463,7.8656,300252061695.0,0.326,29308369223.2,23783476901.2,2012-01-31,0.08235182370820669
2,000008.XSHE,-262.7461,7.0003,517045520.0,-0.5678,-0.5943,770517752.56,-0.006,11679829.03,12030080.04,2012-01-31,0.09978900335112327
3,000060.XSHE,16.476,3.7146,19680455995.0,5.6036,14.617,28009159184.6,0.35,9189386877.65,7935542726.05,2012-01-31,0.12159482758620697
4,000069.XSHE,12.5878,2.5616,41727214853.0,2.8729,10.9097,81247380359.0,0.271,8951453490.28,7091397989.13,2012-01-31,-0.0026808154146886697
分析:
- 初始化VarianceThreshold,指定阀值方差
- 调用fit_transform
def variance_demo():
"""
删除低方差特征——特征选择
:return: None
"""
data = pd.read_csv("factor_returns.csv")
print(data)
# 1、实例化一个转换器类
transfer = VarianceThreshold(threshold=1)
# 2、调用fit_transform
data = transfer.fit_transform(data.iloc[:, 1:10])
print("删除低方差特征的结果:\n", data)
print("形状:\n", data.shape)
return None
返回结果:
index pe_ratio pb_ratio market_cap \
0 000001.XSHE 5.9572 1.1818 8.525255e+10
1 000002.XSHE 7.0289 1.5880 8.411336e+10
... ... ... ... ...
2316 601958.XSHG 52.5408 2.4646 3.287910e+10
2317 601989.XSHG 14.2203 1.4103 5.911086e+10
return_on_asset_net_profit du_return_on_equity ev \
0 0.8008 14.9403 1.211445e+12
1 1.6463 7.8656 3.002521e+11
... ... ... ...
2316 2.7444 2.9202 3.883803e+10
2317 2.0383 8.6179 2.020661e+11
earnings_per_share revenue total_expense date return
0 2.0100 2.070140e+10 1.088254e+10 2012-01-31 0.027657
1 0.3260 2.930837e+10 2.378348e+10 2012-01-31 0.082352
2 -0.0060 1.167983e+07 1.203008e+07 2012-01-31 0.099789
... ... ... ... ... ...
2315 0.2200 1.789082e+10 1.749295e+10 2012-11-30 0.137134
2316 0.1210 6.465392e+09 6.009007e+09 2012-11-30 0.149167
2317 0.2470 4.509872e+10 4.132842e+10 2012-11-30 0.183629
[2318 rows x 12 columns]
删除低方差特征的结果:
[[ 5.95720000e+00 1.18180000e+00 8.52525509e+10 ..., 1.21144486e+12
2.07014010e+10 1.08825400e+10]
[ 7.02890000e+00 1.58800000e+00 8.41133582e+10 ..., 3.00252062e+11
2.93083692e+10 2.37834769e+10]
[ -2.62746100e+02 7.00030000e+00 5.17045520e+08 ..., 7.70517753e+08
1.16798290e+07 1.20300800e+07]
...,
[ 3.95523000e+01 4.00520000e+00 1.70243430e+10 ..., 2.42081699e+10
1.78908166e+10 1.74929478e+10]
[ 5.25408000e+01 2.46460000e+00 3.28790988e+10 ..., 3.88380258e+10
6.46539204e+09 6.00900728e+09]
[ 1.42203000e+01 1.41030000e+00 5.91108572e+10 ..., 2.02066110e+11
4.50987171e+10 4.13284212e+10]]
形状:
(2318, 8)
2.4 相关系数
判断两列数据间的相关性
主要实现方式:
- 皮尔逊相关系数
- 斯皮尔曼相关系数
2.4.1 皮尔逊相关系数(Pearson Correlation Coefficient)
1 作用
反映变量之间相关关系密切程度的统计指标
2 公式计算案例
公式
举例
- 比如说计算年广告费投入与月均销售额
那么之间的相关系数怎么计算
最终计算:
= 0.9942
所以最终得出结论是广告投入费与月平均销售额之间有高度的正相关关系。
3 特点
相关系数的值介于–1与+1之间,即–1≤ r ≤+1。其性质如下:
- 当r>0时,表示两变量正相关,r<0时,两变量为负相关
- 当|r|=1时,表示两变量为完全相关,当r=0时,表示两变量间无相关关系
- 当0<|r|<1时,表示两变量存在一定程度的相关。且|r|越接近1,两变量间线性关系越密切;|r|越接近于0,表示两变量的线性相关越弱
- 一般可按三级划分:|r|<0.4为低度相关;0.4≤|r|<0.7为显著性相关;0.7≤|r|<1为高度线性相关
4 API
from scipy.stats import pearsonr
x : (N,) array_like
y : (N,) array_like Returns: (Pearson’s correlation coefficient, p-value)
5.案例
from scipy.stats import pearsonr
x1 = [12.5, 15.3, 23.2, 26.4, 33.5, 34.4, 39.4, 45.2, 55.4, 60.9]
x2 = [21.2, 23.9, 32.9, 34.1, 42.5, 43.2, 49.0, 52.8, 59.4, 63.5]
pearsonr(x1, x2)
结果,其中第一个值为真正关心的相关系数,第二个值为当样本大于500时值越小相关性越强
(0.9941983762371883, 4.9220899554573455e-09)
2.4.2 斯皮尔曼相关系数(Rank IC)
1 作用:
反映变量之间相关关系密切程度的统计指标
2 公式计算案例(了解,不用记忆)
公式:
n为等级个数,d为二列成对变量的等级差数
举例:
3 特点
- 斯皮尔曼相关系数表明 X (自变量) 和 Y (因变量)的相关方向。 如果当X增加时, Y 趋向于增加, 斯皮尔曼相关系数则为正
- 与之前的皮尔逊相关系数大小性质一样,取值 [-1, 1]之间
斯皮尔曼相关系数比皮尔逊相关系数应用更加广泛
4 API
from scipy.stats import spearmanr
5 案例
from scipy.stats import spearmanr
x1 = [12.5, 15.3, 23.2, 26.4, 33.5, 34.4, 39.4, 45.2, 55.4, 60.9]
x2 = [21.2, 23.9, 32.9, 34.1, 42.5, 43.2, 49.0, 52.8, 59.4, 63.5]
spearmanr(x1, x2)
结果
SpearmanrResult(correlation=0.9999999999999999, pvalue=6.646897422032013e-64)
3 主成分分析
3.1 什么是主成分分析(PCA)
- 定义:高维数据转化为低维数据的过程,在此过程中可能会舍弃原有数据、创造新的变量
- 作用:是数据维数压缩,尽可能降低原数据的维数(复杂度),损失少量信息
- 应用:回归分析或者聚类分析当中
对于信息一词,在决策树中会进行介绍
那么更好的理解这个过程呢? 来看一张图
3.2 API
sklearn.decomposition.PCA(n_components=None)
将数据分解为较低维数空间
n_components:
小数:表示保留百分之多少的信息
整数:减少到多少特征
PCA.fit_transform(X) X:numpy array格式的数据[n_samples,n_features]
返回值:转换后指定维度的array
3.3 数据计算
先拿个简单的数据计算一下
[[2,8,4,5],
[6,3,0,8],
[5,4,9,1]]
from sklearn.decomposition import PCA
def pca_demo():
"""
对数据进行PCA降维
:return: None
"""
data = [[2,8,4,5], [6,3,0,8], [5,4,9,1]]
# 1、实例化PCA, 小数——保留多少信息
transfer = PCA(n_components=0.9)
# 2、调用fit_transform
data1 = transfer.fit_transform(data)
print("保留90%的信息,降维结果为:\n", data1)
# 1、实例化PCA, 整数——指定降维到的维数
transfer2 = PCA(n_components=3)
# 2、调用fit_transform
data2 = transfer2.fit_transform(data)
print("降维到3维的结果:\n", data2)
return None
返回结果:
保留90%的信息,降维结果为:
[[ -3.13587302e-16 3.82970843e+00]
[ -5.74456265e+00 -1.91485422e+00]
[ 5.74456265e+00 -1.91485422e+00]]
降维到3维的结果:
[[ -3.13587302e-16 3.82970843e+00 4.59544715e-16]
[ -5.74456265e+00 -1.91485422e+00 4.59544715e-16]
[ 5.74456265e+00 -1.91485422e+00 4.59544715e-16]]
三 案例
探究用户对物品类别的喜好细分降维
数据如下:
- order_products__prior.csv:订单与商品信息
- 字段:order_id, product_id, add_to_cart_order, reordered
- products.csv:商品信息
- 字段:product_id, product_name, aisle_id, department_id
- orders.csv:用户的订单信息
- 字段:order_id,user_id,eval_set,order_number,….
- aisles.csv:商品所属具体物品类别
- 字段: aisle_id, aisle
1 需求
2 分析
获取数据
数据基本处理
- 合并表格
- 交叉表合并
- 数据截取
特征工程 — PCA
机器学习(k-means)
模型评估
sklearn.metrics.silhouette_score(X, labels)
计算所有样本的平均轮廓系数
X:特征值
labels:被聚类标记的目标值
3 完整代码
import pandas as pd
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.cluster import KMeans
from sklearn.metrics import silhouette_score
- 获取数据
order_product = pd.read_csv("./data/instacart/order_products__prior.csv")
products = pd.read_csv("./data/instacart/products.csv")
orders = pd.read_csv("./data/instacart/orders.csv")
aisles = pd.read_csv("./data/instacart/aisles.csv")
-
数据基本处理
- 合并表格
table1 = pd.merge(order_product, products, on=["product_id", "product_id"]) table2 = pd.merge(table1, orders, on=["order_id", "order_id"]) table = pd.merge(table2, aisles, on=["aisle_id", "aisle_id"])
- 交叉表合并
table = pd.crosstab(table["user_id"], table["aisle"])
- 数据截取
table = table[:1000]
-
特征工程 — PCA
transfer = PCA(n_components=0.9) data = transfer.fit_transform(table)
-
机器学习(k-means)
estimator = KMeans(n_clusters=8, random_state=22) y_predict = estimator.fit_predict(data)
-
模型评估
silhouette_score(data, y_predict)
四 算法选择指导
关于在计算的过程中,如何选择合适的算法进行计算,可以参考scikit learn官方给的指导意见: