蜗牛日记1

本来计划将基因的上游序列调出来然后放到预测转录因子结合位点的网站进行预测,明明延长的是2500bp但是本地blast出的结果却是7000多bp。
不知道该怎么做,然后看到群里的消息,老师需要构一颗系统发育树但是需要在树上将中间节点标志出来。想了一下在EVOLVIEW这个美化树的网站上可以将树的枝长和节点都显示出来。到那时还有一个问题就是得有一颗包括了节点信息的树文件,打开之前上传在EVOLVIEW上的一颗系统发育树上边显示有中间节点,看了一下这颗树的树文件,然后将老师的树文件修改成下图这个模式,标注中间节点的时候直接按着1,2,3,,,顺序标注,不用动脑。'14'这样的内容就对中间节点的标注

虽然现在说起来简单,当时做的时候对老师原始的树文件进行修改就花了好长时间,因为手动修改和添加东西需要很长时间,如果在notepad++中用正则表达式来修改的话会事半功倍而且不会看花眼,几乎零错误率。于是对notepad++的正则表达式研究半天,终于修改成功了。当然老师最后是没有采纳我的结果,老师去请教了权威专家(因为还有的后续步骤还需要请教别人)。不过我还是很高兴,这也算做成了意见完整的事情,并且在此过程中学会了一些小知识,很值得了。

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师姐过来问了我一些作图的东西,师姐几乎没有用过AI,当然我相信其他的绘图软件她应该也不会,我对AI也只是会一些肤皮毛,所以只能教给师姐一些简单的操作。师姐给了我一个动物简画矢量图网站,里面的图都是黑的,不是特别好看,这勾起了我对制作适量图的兴趣,所以捣鼓了半天在百度上搜了搜制作的教程,将一只弓头鲸从图片中抠出来。就是在AI上面工具栏点图像描摹旁的倒三角,选择低保真度照片然后点击扩展就完成了,后续操作可以把边框删掉,取消编组等等。但是图像的清晰度很低不是很好看,然后后面就不知道该怎么操作了,,,

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btw:今天中午还出去吃了碗鸭血粉丝汤,特别棒(菜市场的鸭血粉丝真好吃,然后我就在想为什么这么好吃的东西只能在像菜市场这种没有任何装潢的地方才能吃到,那些景区和大商场卖的鸭血粉丝我敢保证没这么地道),买了一些材料回实验室包饺子,嘿嘿,现在回味一下真有生活的味道!
btw,btw:今天是第一天写csdn博文,,,记录一下我的葱葱岁月可能这样会觉得正一天的时间里我活了两天!!!还好我是一只金鱼,听说金鱼的的记忆只有7秒,还好我这只金鱼会写日志,这样有助于改善健忘症;)

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今天还没有结束呢,下面我要进行我的神操作了,oh my gold,我自己都不敢想想;(
is that a person really glad to see me**?** and or are they just being polite ? some people struggle to distinguish a perfunctory grin from a it’s truly happy smile. and computer have found this task that even more difficult – that is until tell researchers to trained a program to detect when a smile is genuine

the visual computing researchers and at the university brandford of **in the ** UK started ~~for ~~with software for analyzing a changing expression. this program can examine a video clip of a human head and identify specific details around eyes, cheeks and mouse mouth. then the program tracts the details moving relative to each other and as the face smiles next.

坚持听写的话听力应该还有很大进步的,今天就这样吧,第二段比较满意。
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python超菜鸟级别的学习从今天正式开始!
由于安装geany有点慢,还有现在比较晚了,不想太晚回去(每次都是我关灯关门)。所以今天只学习了一丢丢;(

note:
1.变量名不能有空格,想要用空格的话用_代替
2.变量名不能以数字开头
3.变量名也不要用关键字和函数名,这样电脑会被搞蒙的(不过我都不知道函数名有哪些,可能会很巧合就取了个函数名作为变量名,但是我相信电脑会提醒我的)

到现在都还没有下载晚,不管了我必须要会寝室了,明天见!

在使用Python来安装geopandas包时,由于geopandas依赖于几个其他的Python库(如GDAL, Fiona, Pyproj, Shapely等),因此安装过程可能需要一些额外的步骤。以下是一个基本的安装指南,适用于大多数用户: 使用pip安装 确保Python和pip已安装: 首先,确保你的计算机上已安装了Python和pip。pip是Python的包管理工具,用于安装和管理Python包。 安装依赖库: 由于geopandas依赖于GDAL, Fiona, Pyproj, Shapely等库,你可能需要先安装这些库。通常,你可以通过pip直接安装这些库,但有时候可能需要从其他源下载预编译的二进制包(wheel文件),特别是GDAL和Fiona,因为它们可能包含一些系统级的依赖。 bash pip install GDAL Fiona Pyproj Shapely 注意:在某些系统上,直接使用pip安装GDAL和Fiona可能会遇到问题,因为它们需要编译一些C/C++代码。如果遇到问题,你可以考虑使用conda(一个Python包、依赖和环境管理器)来安装这些库,或者从Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages这样的网站下载预编译的wheel文件。 安装geopandas: 在安装了所有依赖库之后,你可以使用pip来安装geopandas。 bash pip install geopandas 使用conda安装 如果你正在使用conda作为你的Python包管理器,那么安装geopandas和它的依赖可能会更简单一些。 创建一个新的conda环境(可选,但推荐): bash conda create -n geoenv python=3.x anaconda conda activate geoenv 其中3.x是你希望使用的Python版本。 安装geopandas: 使用conda-forge频道来安装geopandas,因为它提供了许多地理空间相关的包。 bash conda install -c conda-forge geopandas 这条命令会自动安装geopandas及其所有依赖。 注意事项 如果你在安装过程中遇到任何问题,比如编译错误或依赖问题,请检查你的Python版本和pip/conda的版本是否是最新的,或者尝试在不同的环境中安装。 某些库(如GDAL)可能需要额外的系统级依赖,如地理空间库(如PROJ和GEOS)。这些依赖可能需要单独安装,具体取决于你的操作系统。 如果你在Windows上遇到问题,并且pip安装失败,尝试从Unofficial Windows Binaries for Python Extension Packages网站下载相应的wheel文件,并使用pip进行安装。 脚本示例 虽然你的问题主要是关于如何安装geopandas,但如果你想要一个Python脚本来重命名文件夹下的文件,在原始名字前面加上字符串"geopandas",以下是一个简单的示例: python import os # 指定文件夹路径 folder_path = 'path/to/your/folder' # 遍历文件夹中的文件 for filename in os.listdir(folder_path): # 构造原始文件路径 old_file_path = os.path.join(folder_path, filename) # 构造新文件名 new_filename = 'geopandas_' + filename # 构造新文件路径 new_file_path = os.path.join(folder_path, new_filename) # 重命名文件 os.rename(old_file_path, new_file_path) print(f'Renamed "{filename}" to "{new_filename}"') 请确保将'path/to/your/folder'替换为你想要重命名文件的实际文件夹路径。
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