【3D Slicer】阈值法测量肺部病灶体积

已于 2022-07-09 15:46:44 修改
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分类专栏： 影像组学 文章标签： 大数据
于 2021-08-09 22:19:24 首次发布
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版权

导入图片

  • dicom格式图片通过import DICOM files导入
  • nifit格式图片可以直接拖进去
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下载插件

在Install Extensions中查找下面框选的两个插件安装。

  • LungCTAnalyzer
  • SegmentEditorExtraEffects
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肺部分割

  • 进入插件
    在这里插入图片描述
  • 点击start，根据提示在左、右肺、气管处标点后点击apply
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    在这里插入图片描述
    分割出来的区域可以根据需要在Segment Editor中手动调整。

测量容积

  • 进入插件
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    此处会弹出Error，直接点击ok即可。
  • 设定阈值
    阈值分割出肺大泡等病灶。
    在这里插入图片描述
  • 结果表
    可以根据需要将表用不同格式导出。
    注意：表中 Affected = Infiltrated + Collapsed
    在这里插入图片描述
  • show preview in 3D 查看3d效果
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查看所有数据

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3D Slicer是一款开源的医学图像处理软件，用于可视化和分析医学图像数据。要安装3D Slicer，你可以按照以下步骤进行操作： 1. 首先，你需要访问3D Slicer官方网站，通过注册账号来获得软件的安装包。你可以在3D Slicer的官方网站上找到最新版本的安装程序。 2. 一旦你获得了安装包，你可以双击运行它并按照安装向导的指示进行操作。在安装过程中，你可以选择安装目录和其他选项。 3. 安装完成后，你可以在开始菜单中找到3D Slicer的快捷方式。点击它打开软件。 4. 第一次打开3D Slicer时，你需要选择你想要加载的样本数据。你可以选择从本地计算机加载图像数据，也可以选择从公共数据库中获取数据。 5. 一旦你加载了图像数据，你就可以开始使用3D Slicer进行图像处理和分析了。软件提供了各种工具和功能，让你能够进行3D重建、分割、配准等操作。 总的来说，安装3D Slicer相对简单。只需按照安装向导的指示进行操作，即可在你的计算机上安装和启动这个强大的医学图像处理软件。

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