疾病负担研究（GBD）-如何优雅的展示发病率数据

已于 2022-01-28 15:24:37 修改
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分类专栏： GBD数据库 文章标签： 回归 数据挖掘
于 2021-12-22 18:37:56 首次发布
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本文介绍了如何基于GBD数据，利用线性回归计算年平均发病变化率(EAPC)来展示疾病发病率趋势。通过R语言处理数据，计算EAPC，并整合95%可信区间，制作出专业表格，简化了复杂的数据呈现过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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本文是GBD的第三篇推文，今天我们就以已经发表的高分GBD文章来看下如何展示GBD数据，本文案例文章是发表在JOURNAL OF HEPATOLOGY的肝癌GBD研究，题目为The trends in incidence of primary liver cancer caused by specific etiologies: Results from the Global Burden of Disease Study 2016 and implications for liver cancer prevention.

在文中，作者用一个表格展示了1990到2016年的疾病发病数以及年龄校正后的标准发病率，同时作者估计了从1990到2016年之间的年平均发病变化率（estimated annual percentage change, EAPC）。

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GBD数据库——如何绘制SDI与发病率的相关图
weixin_44240228的博客
04-10 3580
文章首发于微信公众号——小明学习室，欢迎大家关注 如需要加入GBD数据交流群，请加小编微信“Endoscopy_1991”,小编拉你进群 这篇推文是GBD系列的第8篇，我们可以看下另外一篇示例文章The global, regional, and national burden of oesophageal cancer and its attributable risk factors in 195 countries and territories, 1990–2017: a systematic
GBD数据库相关文献中的EAPC怎么算？
NickyCat的博客
07-10 8948
发现近年来好多人利用GBD数据库发了很多文章。 GBD数据库（http://ghdx.healthdata.org/gbdresults-tool）中关于疾病的发生率、死亡率、DALY等数据都是现成的，所以主要的工作量包括： 下载数据并整理成表格：用R比较方便，用Excel也行； 数据的可视化（画图）：用R的ggplot包比较方便，推荐参考书籍： Winston Chang. R数据可视化手册（异步图书）人民邮电出版社 相关变化趋势的计算：常用方法的是Estimated annual percentage
GBD数据库有多好发文？中国学者又发一区（IF=12.5） | GBD数据库周报
郑老师统计
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疾病负担研究（GBD）-如何绘制GBD相关性图
weixin_44240228的博客
02-19 2668
本篇是GBD相关的第5篇推文，接着上一次的推文，我们同样来看那个范例文章，图2-4是一个比较简单的条形图，这里我们就不展示了。我们来看看图5中的B与C图是如何做出来的 我们首先来看图B如何绘制，可以看到这个是相关性分析的散点图，图B是ASR与EAPC的散点图，图中圆圈大小表示1990的绝对病例数。我们可以在它的基础上直接把ASDR与ASIR与EAPC的相关性画在一张图中。绘制之前我们需要得到3个数据结果：ASR、EAPC以及发病例数。 我们读取数据 我们首先获取ASIR以及发病例数 计算
IF=36.4！GBD 2021数据库一周拿下两篇Lancet | GBD数据库周报（7.31~8.6）
最新发布
weixin_47988917的博客
08-14 662
作为我们的宝藏数据库，GBD的表现可以说是相当亮眼！本周我们发现了两篇用GBD 2021数据发表在Lancet的文章，一篇当然是GBD官方合作者，另外一篇却是我们中国学者！虽然是lancet子刊，但选题和思路都较为创新。全球疾病负担（GBD）是迄今为止规模最大、最全面的一项研究，旨在量化不同地区和不同时期的健康损失，从而改善卫生系统并消除差异。该研究由华盛顿大学健康指标与评估研究所 (IHME) ...
疾病负担研究（GBD）-数据下载及解读
weixin_44240228的博客
12-15 7005
接着上一节，我们介绍了GBD大概的情况，今天我们来聊一聊如何下载数据，并利用下载的数据进行有目的的取舍分析。因为涉及的内容挺多，我们就限定某一部分人群进行描述，掌握了这一部分，其他部分基本上可以类推，采用的分析软件使用R语言就行分析。 比如我们现在想要分析2019食管癌全球及各大洲的年龄校正后的发病率、死亡率这两个数据，以及随时间变化的情况，其他几个衡量数据基本上可以类推。 进入主界面后我们首先需要限定条件后下载我们想要的数据 年份我们全部勾选 地区我们选择Select only G
GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家
weixin_44240228的博客
02-28 1536
文章首发于微信公众号——小明学习室，欢迎大家关注 如需要加入GBD数据交流群，请加小编微信“Endoscopy_1991”,小编拉你进群 本次推文是GBD系列的第6篇，我们可以看示例文章中的Fig S1 通过聚类的方法将各个国家的发病率分为4组，我们可以看下文章里的方法描述部分： 可以看出这个方法是采用层次聚类分析的方法对发病率的EAPC进行聚类分组，查了相关的R包后，发现factoextra这个R包可以做层次聚类分析，并能做出相应的图形来。我们可以在图S1的基础上增加内容，我们比如可以根据
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疾病负担研究（GBD）-如何让风险因素数据更好看
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文章首发于微信公众号——小明学习室，欢迎大家关注 如需要加入GBD数据交流群，请加小编微信“Endoscopy_1991”,小编拉你进群 这篇文章是GBD系列的第七篇推文，介绍了前面高分示例文章里的图形后，我们基本上可以呈现简单的发病率以及死亡率数据了，接下来一般比较常规的分析还会增加关于风险因素的结果展示，我们可以看下发表在lancet子刊上的The global, regional, and national burden of oesophageal...
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今天我们来聊一聊第一个公共数据库——GBD数据库，全称叫做global burden of disease（全球疾病负担），该数据库每年都会更新，目前已经更新到GBD2019。 这里直接给大家贴出网址：Global Burden of Disease Study 2019 (GBD 2019) Data Resources | GHDx 上图中红色圈圈标识的就是数据库的数据获取界面的链接，大家直接点击即可. 数据的检索十分方便： Context下拉菜单中可以选择不同的选项，默认是caus
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08-08
GBD是GNU调试器（GNU Debugger）的简称，是一个功能强大的调试工具，它可以用于调试各种编程语言的程序，包括Python。GBD可以帮助我们在程序运行时定位和解决问题，包括查看调用栈、变量的值等等。 在Python中使用GBD调试时，我们可以通过以下几个命令来获取有关Python调用栈的信息： - `bt`命令可以将C调用栈完整打印出来，包括Python解释器和Python扩展模块的调用信息。 - `py-bt`命令可以只显示Python调用栈，这对于分析Python程序的问题非常有用。需要注意的是，使用`py-bt`命令前，我们需要安装python-dbg才能使用。 - `py-list`命令可以查看当前程序的Python代码，相当于pdb的`ll`命令。 通过查看调用栈信息和Python代码，我们可以更好地理解程序的执行过程，找出问题所在。举个例子，从上图中可以看出，程序目前在Python的timemodule.c的pysleep方法中，最终调用了Linux系统的select.c来实现Python进程中主线程的sleep操作。 总之，GBD是一个强大的调试工具，可以帮助我们在Python程序中定位问题，并提供有用的调试信息。通过使用命令如`bt`、`py-bt`和`py-list`，我们可以获取调用栈和Python代码的相关信息，帮助我们更好地理解和解决问题。
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