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这次是GBD相关的第10篇推文。
后台有朋友反应如何使用joinpoint软件计算AAPC。这次我们将讲解GBD数据计算AAPC的软件操作过程。
首先我们需要下载好软件,具体到官网下载(https://surveillance.cancer.gov/joinpoint/download),填写好信息后即可下载桌面软件。
接着我们准备好用于joinpoint的数据,我们同样以食管癌为示范进行操作
打开R语言,读取食管癌1990到2019年的发病率数据
由于joinpoint需要发病率以及标准误数据,因此我们需要得到标准误数据,我们根据可信区间的定义公式95%UI=mean+/-1.96*standard error,因此standard error= (up-lower)/(1.96*2),而且joinpoint软件要求年份按照升序排列,且一个组放在一起,因此我们计算出standard error后对EAPC数据location,year进行升序排列,并输出结果
我们打开数据文件,可以看下格式
我们打开joinpoint软件,选择file目录的new session,找到joinpoint.csv文件打开