疾病负担研究（GBD）——如何使用joinpoint软件计算AAPC

最新推荐文章于 2024-07-01 08:06:05 发布
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分类专栏： GBD数据库 文章标签： r语言 数据挖掘 大数据 数据库
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_44240228/article/details/125379773
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本文介绍了如何使用joinpoint软件计算全球疾病负担（GBD）研究中的平均年度变化百分比（AAPC）。首先从官网下载软件，接着在R语言中处理数据得到标准误，然后在joinpoint中设置参数进行分析。重点讲述了建模方法、模型优化和指标计算，包括年度变化百分比（APC）和AAPC的计算。最后，文章提到了如何导出结果并在R中进一步处理。
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关于GBD数据库的实操视频已经陆续更新，如需要，大家可以关注B站的“小明学习室”。

这次是GBD相关的第10篇推文。

后台有朋友反应如何使用joinpoint软件计算AAPC。这次我们将讲解GBD数据计算AAPC的软件操作过程。

首先我们需要下载好软件，具体到官网下载（https://surveillance.cancer.gov/joinpoint/download），填写好信息后即可下载桌面软件。

接着我们准备好用于joinpoint的数据，我们同样以食管癌为示范进行操作

打开R语言，读取食管癌1990到2019年的发病率数据

由于joinpoint需要发病率以及标准误数据，因此我们需要得到标准误数据，我们根据可信区间的定义公式95%UI=mean+/-1.96*standard error，因此standard error= (up-lower)/(1.96*2)，而且joinpoint软件要求年份按照升序排列，且一个组放在一起，因此我们计算出standard error后对EAPC数据location，year进行升序排列，并输出结果

我们打开数据文件，可以看下格式

我们打开joinpoint软件，选择file目录的new session，找到joinpoint.csv文件打开

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gdb 是一个强大的调试工具，可以帮助开发者发现程序中的错误。以下是 gbd 的一些基本使用方法： 1. 编译时加上 -g 参数，生成可调试的二进制文件 例如，编译一个 C 语言程序时，可以使用以下命令： ``` gcc -g -o program program.c ``` 2. 启动 gdb 在终端中输入以下命令： ``` gdb program ``` 其中，program 是要调试的可执行文件名称。 3. 设置断点 在程序中设置断点，可以让程序在指定位置停下来，以便调试。 例如，在函数 foo 中设置断点： ``` break foo ``` 4. 运行程序 在 gdb 命令行中输入以下命令，运行程序： ``` run ``` 5. 单步执行程序 在 gdb 命令行中输入以下命令，单步执行程序： ``` step ``` 6. 查看变量的值 在 gdb 命令行中输入以下命令，查看变量的值： ``` print variable_name ``` 其中，variable_name 是要查看的变量名称。 7. 修改变量的值 在 gdb 命令行中输入以下命令，修改变量的值： ``` set variable_name = new_value ``` 其中，variable_name 是要修改的变量名称，new_value 是新的变量值。 8. 结束程序的执行 在 gdb 命令行中输入以下命令，结束程序的执行： ``` quit ``` 以上是 gbd 一些基本的使用方法，更多的 gbd 使用技巧可以参考 gdb 的官方文档。
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