1、mkdir --创建目录
mkdir do --在当前目录下创建名为do的子目录
mkdir do/align --在子目录下创建名为align的子目录
mkdir -p hab/tree --在当前目录下创建名为hba的子目录,并在子目录下创建名为tree的子目录
2、rmdir --删除目录
rmdir tmp --删除当前目录下名为tmp的子目录,该子目录没有文件和子目录
3、cd --改变目录
cd --回到用户主目录,即登录时进入的目录
cd do --进入子目录do
cd … --回到上级目录
cd hba/tree --直接进入子目录hba下的tree子目录
cd …/do/align --进入上级目录do下的align子目录
4、ls --显示文件或目录
ls --显示当前目录下的子目录和文件名
ls -l --显示当前目录下的子目录和文件名详细信息,包括属性、权限、大小和创建日期等
ls *.fasta --显示当前目录下所有以.fasta结尾的文件
ls hba/hba1_* --显示子目录hba下所有以 hba1_ 起始的文件
ls ./tmp --显示/tmp目录下所有的子目录和文件
ls -lR --逐级显示当前目录及子目录下所有的子目录和文件
ls -l --显示当前目录下的子目录和文件名详细信息(类似ls - l)
5、cat --显示或编辑文本文件
cat > cat1 --往cat1中逐行输入文本,用ctrl -D 结束输入
cat >> cat1 --往cat1中逐行追加文本,用ctrl -D 结束输入
cat cat1 – 显示文本文件cat1中的内容
6、less --显示文件内容
less 209hba.list --逐行显示文件209hba.list内容,回车进一行,空格进一页,q终止显示
7、cp --复制文件
cp seq1 seq2 --将文件seq1复制到文件seq2中,保留seq1
cp *.fasta …/keep/ --将所有文件名以.fasta结尾的文件复制到上级目录的keep子目录中
cp …/seq/hba_human.sw . --将上级目录的seq子目录中名为hba_human.sw 的文件复制到当前目录中
cp /tmp/tf/zmtf-pep.fasta blast/ --将/tmp目录中tf子目录名为 zmtf-pep.fasta blast的文件复制到当前目录中名为blast的子目录中
8、mv --更改文件名ls
mv seq1 seq2 --将文件seq1改名为seq2,不保留seq1
mv hba_human.fasta pku08s1/hba --将当前目录下文件hba_human.fasta移到子目录pku08s1 下的子目录hba中
9、rm --删除文件或目录
rm seq2 --删除文件seq2
rm *.txt --删除所有以.txt结尾的文件
rm -r temp/* --删除子目录temp下所有子目录和文件,保留该目录
rm -r temp --删除子目录temp和该目录下所有子目录和文件
10、chmod --改变文件或目录权限
chmod -w ppf1.fas --取消所有用户对ppf1.fas的写权限
chmod +w seq1 --将当前目录下seq1设置为本用户可写,其他用户权限不变
chmod -w keep/ --取消子目录keep写权限,不能在该目录下创建和删除文件或子目录
chmod 755 bin/* --将子目录bin下所有文件设置为本用户可读可写可执行,其他用户可读可执行