使用Python实现PCA降维可以通过scikit-learn库中的PCA模块来实现。在进行降维时,可以选择保留多少贡献度来确定降维后的维度。
下面是一个示例代码,展示了如何使用Python进行PCA降维及选择保留的贡献度:
from sklearn.decomposition import PCA
# 假设有一个输入数据的矩阵 X,n_samples 表示样本数量,n_features 表示每个样本的特征数
X = ...
# 创建PCA对象
pca = PCA()
# 对数据进行PCA降维
X_new = pca.fit_transform(X)
# 贡献度累计比例
explained_variance_ratio_cumulative = np.cumsum(pca.explained_variance_ratio_)
# 设置保留的贡献度阈值
threshold = 0.95
# 找到保留贡献度阈值的维度
n_components = np.argmax(explained_variance_ratio_cumulative >= threshold) + 1
# 使用保留的维度进行PCA降维
pca = PCA(n_components=n_components)
X_new = pca.fit_transform(X)
上述代码中,首先导入需要的库。接着,假设有一个数据矩阵 X,我们创建了一个PCA对象。然后,调用PCA对象的fit_transform()
方法来对数据进行PCA降维,得到降维后的数据矩阵 X_new。
紧接着,我们计算了贡献度的累计比例,并设置了一个保留的贡献度阈值(threshold)。通过找到累计比例大于等于阈值的维度索引,我们确定了保留的维度数量(n_components)。
最后,我们使用保留的维度数量进行PCA降维,并得到降维后的数据矩阵 X_new。
通过以上步骤,我们利用Python成功实现了PCA降维,并选择了要保留的贡献度来确定降维后的维度。您可以根据具体需求自行调整贡献度阈值来控制降维后的维度数量。