无root权限在redhat服务器集群安装R语言

系统介绍

$ uname -a
Linux tc6000 3.10.0-693.el7.x86_64 #1 SMP Wen Feb 9 21:43:51 EDT 2013 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

$ cat /proc/version
Linux version 3.10.0-693.el7.x86_64 (mockbuild@x86-038.build.eng.bos.redhat.com) (gcc version 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-16) (GCC) ) #1 SMP Wen Feb 9 21:43:51 EDT 2013

$ lsb_release -a
LSB Version:    :core-4.1-amd64:core-4.1-noarch:cxx-4.1-amd64:cxx-4.1-noarch:desktop-4.1-amd64:desktop-4.1-noarch:languages-4.1-amd64:languages-4.1-noarch:printing-4.1-amd64:printing-4.1-noarch
Distributor ID: RedHatEnterpriseServer
Description:    Red Hat Enterprise Linux Server release 7.4 (Maipo)
Release:        7.4
Codename:       Maipo

$ cat /etc/redhat-release
Red Hat Enterprise Linux Server release 7.4 (Maipo)

我安装的R版本是：

R-3.6.2.tar.gz

首先安装四个依赖

需要建立一个文件夹专门用于存放依赖，创建该文件夹，你可以自定义这个文件夹，但是注意后面的路径也要替换：

$ mkdir /public/home/wcl/software/r

然后下载四个依赖，这里主要参考的去SCI666的方法，可以点击蓝字查看。
下载了pcre2-10.37.zip、bzip2-bzip2-1.0.8.tar.gz、curl-7.47.1.tar.gz、xz-5.4.3.tar.gz四个包 。
然后就是按照SCI666和果蝇的小翅膀的方法，

$ cd /public/home/clwei/software/r
$ wget https://tukaani.org/xz/xz-5.4.3.tar.gz
$ tar xzvf xz-5.4.3
$ cd xz-5.4.3
$ ./configure --prefix=/public/home/clwei/software/r/rpackages
$ make -j3
$ make install

$ cd /public/home/clwei/software/r
$ wget https://sourceforge.net/projects/pcre/files/pcre2/10.37/pcre2-10.37.zip/download
$ unzip pcre2-10.37.zip
$ cd pcre2-10.37
$ ./configure --enable-utf8 --prefix=/public/home/clwei/software/r/rpackages
$ make -j3
$ make install

$ cd /public/home/clwei/software/r
$ wget --no-check-certificate https://curl.se/download/curl-7.47.1.tar.gz
$ tar xzvf curl-7.47.1.tar.gz
$ cd curl-7.47.1
$ ./configure --prefix=/public/home/clwei/software/r/rpackages
$ make -j3
$ make install

根据草莓苹果大橘子和韩建刚（CAAS-UCD）添加环境变量：

$ cd ~
$ vi .bash_profile

$ export PATH=/public/home/clwei/software/r/rpackages/bin:$PATH
$ export LD_LIBRARY_PATH=\$LD_LIBRARY_PATH:\$LD_LIBRARY_PATH # 是的，LD_LIBRARY_PATH 没有定义，但是没问题，我猜是程序自己的常量
$ export CFLAGS="-I/HOME/packages/include"
$ export LDFLAGS="-L/HOME/packages/lib"

$ source .bash_profile

然后开始编译R

$ cd /public/home/clwei/software/r/R-4.3.0
$ wget https://cran.r-project.org/src/base/R-4/R-4.3.0.tar.gz
$ tar -xzvf R-4.3.0.tar.gz
$ cd /public/home/clwei/software/r/R-4.3.0
$ ./configure --prefix=/public/home/clwei/software/R/R  --enable-R-shlib --with-readline=no --with-libpng=yes --with-blas --with-x=no
$ make -j3
$ make install

添加环境变量

$ vi .bash_profile

# 在PATH后面加一段代码
R_HOME= /public/home/clwei/software/r
export PATH=$PATH:$R_HOME/bin

$ source .bash_profile

就酱。