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Lasgalena
这个作者很懒,什么都没留下…
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【阅读总结】Variant Effect Predictor: ProteinNPT 半监督伪条件生成
ProteinNPT于2023年发表于NeurIPS Proceedings,能够将无监督预测作为辅助标签,和真实标签一起用于训练网络,做半监督学习。截止到2024.10.08,ProteinNPT于是ProteinGym DMS Substitutions数据上有监督学习的最佳模型。原创 2024-10-08 09:09:11 · 1260 阅读 · 0 评论 -
【阅读总结】Variant Effect Predictor: TranceptEVE、EVEscape、popEVE
TranceptEVE、EVEscape、popEVE原创 2024-10-06 15:00:28 · 1377 阅读 · 0 评论 -
【阅读总结】Variant Effect Predictor: Tranception 自回归预测 + ProteinGym 基准数据集
本系列整理了Debora课题组一系列基于深度生成模型预测致病突变的工作,包括EVE、Tranception、TranceptEVE、EVEscape和popEVE,主要讨论数据来源与处理、模型架构与训练、性能测试与实例。原创 2024-08-20 22:41:20 · 962 阅读 · 0 评论 -
【阅读总结】Variant Effect Predictor: EVE 深度生成模型预测致病突变
本系列旨在整理Debora课题组一系列基于深度生成模型预测致病突变的工作,包括EVE、Tranception、TranceptEVE、EVEscape和popEVE,讨论数据来源与处理、模型架构与训练、性能测试与实例。原创 2024-08-15 15:58:22 · 883 阅读 · 0 评论 -
【阅读总结】AlphaFold3 unedited version 通读 + 服务器使用总结
AlphaFold3能做什么:预测蛋白质、DNA、RNA与允许的配体/离子/共价修饰的复合物结构为什么要用AlphaFold3:有强大的泛化性和准确率,除了RNA结构略差于AIchemy_RNA2外,预测精度高于现有方法(包括Vina和RosettaFold-All-Atom)AlphaFold3怎么用:代码不开源,网站需注册使用,每日限制提交任务(2024/05/17为每日20次提交)原创 2024-05-17 14:51:44 · 5362 阅读 · 1 评论