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RSS订阅原创 【plink --epistasis】解决Error: --epistasis requires at least two cases and two controls.
plink --fast-epistasis 只能分析二分类的表型plink --epistasis 可以分析多分类或者连续性的表型需要准备1、将vcf文件转换为ped、map或者bed、bim、fam文件2、表型文件具体参考：https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.html可能会遇到报错：Error: --epistasis requires at least two cases and two controls.这可能是因为表型文件和
2022-06-13 11:11:07
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原创 Plink提取tagSNPs
Plink提取tagSNPs1）识别haplotype block在提取tagSNPs之前需要先识别haplotype block，这一步的代码很多教程里都给了出来：plink --file mydata --blocks这里的mydata是由vcf文件经过plink转换来的，如果是ped/map格式的文件(mydata.ped/mydata.map)，就用**–file**如果是bed/fam格式的文件(mydata.bed/mydata.fam)，就用**–bfile**当我自己运行的时
2021-05-03 22:13:26
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空空如也
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