上面的图片可有可无,下面才是重点!
- 更新apt包
apt update
apt-get update
- 下载相应依赖
apt -y install gcc
apt install make
apt install ruby ruby-dev rubygems-integration
apt-get install ncbi-blast+
- 给gem换源(接下来下载sequenceserver会更快些)
gem sources --add https://gems.ruby-china.com/ --remove https://rubygems.org/
- 下载sequenceserver(需要时间等待)
gem install sequenceserver
- 下载成功的标志
- 找到sequenceserver的安装位置
whereis sequenceserver #下面一行是我的sequenceserver的安装位置
sequenceserver: /usr/local/bin/sequenceserver
- 进入sequenceserver的安装目录并创建一个数据库文件夹将已有的.fa文件移动到这个数据库文件夹下(记住这个数据库文件夹的绝对路径下面要用)
cd /usr/local/bin/ #进入sequenceserver的安装目录
mkdir db #创建db文件夹
- 运行sequenceserver
sequenceserver
- 提示你需要输入数据库的路径(此处的路径为上文提到的路径)
- 输入路径后(接下来根据提示默认或按Y就可以了)
- 成功,在浏览器上根据下文的提示浏览就可以了(本文在浏览器输入http://localhost:4567就可以了,如使用的docker不要忘记docker的端口映射,根据自己的端口访问)