在使用
conda install -c conda-forge scanpy python-igraph leidenalg
后,使用scanpy时出现了如上问题,原因可能是conda下载的h5py有问题。
解决方法:
- 先卸载h5py
conda uninstall h5py
- 在h5py官网下载包 https://pypi.org/project/h5py/
- Anaconda prompt 进入下载路径,pip安装h5py
- 下载scanpy
pip install scanpy
注:不能使用conda install,否则h5py又要下载错误的包