Quantum Espresso Hands-On实战训练（一）——DFT能带计算

最新推荐文章于 2023-08-21 19:10:12 发布
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分类专栏： pwscf 文章标签： centos
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版权

文章目录

计算步骤

一般来说有以下过程

  1. scf自洽
  2. nscf （bands）计算
  3. 后处理
    前两步的主要区别在网格选取，第一步主要采用非密集网格，诸如
K_POINTS automatic 
  5 5 5   1 1 1

第二步主要采用K点路径，诸如VASPKIT杂化泛函产生的Kpoints，以及Seek-Path等

K_POINTS crystal 
202 
   0.000000000    0.000000000    0.000000000      1.000000000 
   0.011111111    0.000000000    0.011111111      1.000000000 
   0.022222222    0.000000000    0.022222222      1.000000000 
   0.033333333    0.000000000    0.033333333      1.000000000 
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   0.055555556    0.000000000    0.055555556      1.000000000 
   0.066666667    0.000000000    0.066666667      1.000000000 
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   0.111111111    0.000000000    0.111111111      1.000000000 
   0.122222222    0.000000000    0.122222222      1.000000000 
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   0.333333333    0.000000000    0.333333333      1.000000000 
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   0.422222222    0.000000000    0.422222222      1.000000000 
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   0.477777778    0.000000000    0.477777778      1.000000000 
   0.488888889    0.000000000    0.488888889      1.000000000 
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   0.141025641    0.141025641    0.141025641      1.000000000 
   0.153846154    0.153846154    0.153846154      1.000000000 
   0.166666667    0.166666667    0.166666667      1.000000000 
   0.179487180    0.179487180    0.179487180      1.000000000 
   0.192307692    0.192307692    0.192307692      1.000000000 
   0.205128205    0.205128205    0.205128205      1.000000000 
   0.217948718    0.217948718    0.217948718      1.000000000 
   0.230769231    0.230769231    0.230769231      1.000000000 
   0.243589744    0.243589744    0.243589744      1.000000000 
   0.256410256    0.256410256    0.256410256      1.000000000 
   0.269230769    0.269230769    0.269230769      1.000000000 
   0.282051282    0.282051282    0.282051282      1.000000000 
   0.294871795    0.294871795    0.294871795      1.000000000 
   0.307692308    0.307692308    0.307692308      1.000000000 
   0.320512821    0.320512821    0.320512821      1.000000000 
   0.333333333    0.333333333    0.333333333      1.000000000 
   0.346153846    0.346153846    0.346153846      1.000000000 
   0.358974359    0.358974359    0.358974359      1.000000000 
   0.371794872    0.371794872    0.371794872      1.000000000 
   0.384615385    0.384615385    0.384615385      1.000000000 
   0.397435897    0.397435897    0.397435897      1.000000000 
   0.410256410    0.410256410    0.410256410      1.000000000 
   0.423076923    0.423076923    0.423076923      1.000000000 
   0.435897436    0.435897436    0.435897436      1.000000000 
   0.448717949    0.448717949    0.448717949      1.000000000 
   0.461538461    0.461538461    0.461538461      1.000000000 
   0.474358974    0.474358974    0.474358974      1.000000000 
   0.487179487    0.487179487    0.487179487      1.000000000 
   0.500000000    0.500000000    0.500000000      1.000000000 
   0.500000000    0.491935484    0.508064516      1.000000000 
   0.500000000    0.483870968    0.516129032      1.000000000 
   0.500000000    0.475806452    0.524193548      1.000000000 
   0.500000000    0.467741935    0.532258065      1.000000000 
   0.500000000    0.459677419    0.540322581      1.000000000 
   0.500000000    0.451612903    0.548387097      1.000000000 
   0.500000000    0.443548387    0.556451613      1.000000000 
   0.500000000    0.435483871    0.564516129      1.000000000 
   0.500000000    0.427419355    0.572580645      1.000000000 
   0.500000000    0.419354839    0.580645161      1.000000000 
   0.500000000    0.411290323    0.588709677      1.000000000 
   0.500000000    0.403225807    0.596774194      1.000000000 
   0.500000000    0.395161290    0.604838710      1.000000000 
   0.500000000    0.387096774    0.612903226      1.000000000 
   0.500000000    0.379032258    0.620967742      1.000000000 
   0.500000000    0.370967742    0.629032258      1.000000000 
   0.500000000    0.362903226    0.637096774      1.000000000 
   0.500000000    0.354838710    0.645161290      1.000000000 
   0.500000000    0.346774193    0.653225806      1.000000000 
   0.500000000    0.338709677    0.661290323      1.000000000 
   0.500000000    0.330645161    0.669354839      1.000000000 
   0.500000000    0.322580645    0.677419355      1.000000000 
   0.500000000    0.314516129    0.685483871      1.000000000 
   0.500000000    0.306451613    0.693548387      1.000000000 
   0.500000000    0.298387097    0.701612903      1.000000000 
   0.500000000    0.290322581    0.709677419      1.000000000 
   0.500000000    0.282258065    0.717741935      1.000000000 
   0.500000000    0.274193548    0.725806452      1.000000000 
   0.500000000    0.266129032    0.733870968      1.000000000 
   0.500000000    0.258064516    0.741935484      1.000000000 
   0.500000000    0.250000000    0.750000000      1.000000000 
   0.500000000    0.238636364    0.738636364      1.000000000 
   0.500000000    0.227272727    0.727272727      1.000000000 
   0.500000000    0.215909091    0.715909091      1.000000000 
   0.500000000    0.204545455    0.704545454      1.000000000 
   0.500000000    0.193181818    0.693181818      1.000000000 
   0.500000000    0.181818182    0.681818182      1.000000000 
   0.500000000    0.170454545    0.670454546      1.000000000 
   0.500000000    0.159090909    0.659090909      1.000000000 
   0.500000000    0.147727273    0.647727273      1.000000000 
   0.500000000    0.136363636    0.636363636      1.000000000 
   0.500000000    0.125000000    0.625000000      1.000000000 
   0.500000000    0.113636364    0.613636364      1.000000000 
   0.500000000    0.102272727    0.602272727      1.000000000 
   0.500000000    0.090909091    0.590909091      1.000000000 
   0.500000000    0.079545455    0.579545454      1.000000000 
   0.500000000    0.068181818    0.568181818      1.000000000 
   0.500000000    0.056818182    0.556818182      1.000000000 
   0.500000000    0.045454545    0.545454546      1.000000000 
   0.500000000    0.034090909    0.534090909      1.000000000 
   0.500000000    0.022727273    0.522727273      1.000000000 
   0.500000000    0.011363636    0.511363636      1.000000000 
   0.500000000    0.000000000    0.500000000      1.000000000

有时候偷懒，对于LDA和GGA泛函，计算量比较小，可直接采用nscf或bands的K点，进行scf计算后直接得到能带结构。

scf-bands获得能带结构

  1. scf自洽
 &CONTROL
                       title = 'LDA.inp' ,
                 calculation = 'scf' ,
                restart_mode = 'from_scratch' ,
                  pseudo_dir = '/home/flyingd/Desktop/LDA/pseorsu/' ,
 /
 &SYSTEM
                       ibrav = 0,
                         nat = 2,
                        ntyp = 1,
                     ecutwfc = 50 ,
                     ecutrho = 200 ,
                        nbnd = 8,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 1d-9 ,
                    smearing = 'gaussian' ,
 /
 &ELECTRONS
 /
CELL_PARAMETERS angstrom 
    -0.000000000    2.681233128    2.681233128 
     2.681233128   -0.000000000    2.681233128 
     2.681233128    2.681233128    0.000000000 
ATOMIC_SPECIES
   Si   28.08550  Si.pz-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF 
ATOMIC_POSITIONS crystal 
   Si      0.000000000    0.000000000    0.000000000    
   Si      0.250000000    0.250000000    0.250000000    
K_POINTS automatic 
  5 5 5   1 1 1
  1. nscf或bands
 &CONTROL
                       title = 'LDA.inp' ,
                 calculation = 'bands' ,
                  pseudo_dir = '/home/flyingd/Desktop/LDA/pseorsu/' ,
 /
 &SYSTEM
                       ibrav = 0,
                         nat = 2,
                        ntyp = 1,
                     ecutwfc = 50 ,
                     ecutrho = 200 ,
                        nbnd = 8,
                       nosym = .false. ,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 1d-9 ,
                    smearing = 'gaussian' ,
 /
 &ELECTRONS
 /
CELL_PARAMETERS angstrom 
    -0.000000000    2.681233128    2.681233128 
     2.681233128   -0.000000000    2.681233128 
     2.681233128    2.681233128    0.000000000 
ATOMIC_SPECIES
   Si   28.08550  Si.pz-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF 
ATOMIC_POSITIONS crystal 
   Si      0.000000000    0.000000000    0.000000000    
   Si      0.250000000    0.250000000    0.250000000    
K_POINTS crystal 
202 
   0.000000000    0.000000000    0.000000000      1.000000000 
   0.011111111    0.000000000    0.011111111      1.000000000 
   0.022222222    0.000000000    0.022222222      1.000000000 
   0.033333333    0.000000000    0.033333333      1.000000000 
   0.044444444    0.000000000    0.044444444      1.000000000
  1. 后处理及能带可视化
    新建bands.inp作为bands.x的输入文件
&bands
prefix='pwscf',
outdir='./'
filband='bd.dat'
lp=.true.
/

bands.x -i bands.inp

得到bd.dat.gnu文件，gnuplot

gnuplot
plot "bd.dat.gnu"

或直接运行脚本（nscf+后处理）

#!/bin/bash
read -p "input file(scf/band/nscf/etc.pw.in) :" filename
mpirun -np 2 pw.x < $filename > $filename.out
sleep 2
while true
 do
 process=`pgrep pw.x`
  if [ "$process" == "" ]; then
                echo "pw.x ending, start bands.x/gnuplot";
		bands.x -i bands.inp		
		gnuplot -persist <<EOF
		set term x11
		plot "bd.dat.gnu"	
EOF
		break;
        else
                echo "process exsits";
        fi
 done

即可得到能带图
LDA计算的硅的能带

scf直接获得能带

  1. Kpath自定义
VASPKIT产生Kpath，修改Kpath为自己想用的。
通过251命令产生Kpoints，删除有权重的k点，将权重0的点改为权重为1的点。
或者采用Seek-Path
K_POINTS crystal 
127
    0.50000000000000    0.50000000000000    0.50000000000000     1
    0.48437500000000    0.48437500000000    0.48437500000000     1
    0.46875000000000    0.46875000000000    0.46875000000000     1
    0.45312500000000    0.45312500000000    0.45312500000000     1
    0.43750000000000    0.43750000000000    0.43750000000000     1
    0.42187500000000    0.42187500000000    0.42187500000000     1
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    0.50000000000000    0.25000000000000    0.75000000000000     1
  1. pw输入文件
 &CONTROL
                       title = 'LDA.inp' ,
                 calculation = 'scf' ,
                  pseudo_dir = '/home/flyingd/Desktop/LDA1/pseorsu/' ,
 /
 &SYSTEM
                       ibrav = 0,
                         nat = 2,
                        ntyp = 1,
                     ecutwfc = 50 ,
                     ecutrho = 200 ,
                        nbnd = 8,
                 occupations = 'smearing' ,
                     degauss = 1d-9 ,
                    smearing = 'gaussian' ,
 /
 &ELECTRONS
 /
CELL_PARAMETERS angstrom 
    -0.000000000    2.681233128    2.681233128 
     2.681233128   -0.000000000    2.681233128 
     2.681233128    2.681233128    0.000000000 
ATOMIC_SPECIES
   Si   28.08550  Si.pz-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF 
ATOMIC_POSITIONS crystal 
   Si      0.000000000    0.000000000    0.000000000    
   Si      0.250000000    0.250000000    0.250000000
  1. 计算成功后后处理。bands.x产生bd.dat后
  2. 运行，依次输入
plotband.x
bd.dat
-10,20
xmgr
z.ps
6
1,6
  1. 得到能带图

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