前言
日期:2024.2.2
最近在用snapATAC2分析scATAC数据的时候遇见的报错:AttributeError: Module ‘scipy’ has no attribute ‘array’,记录解决过程
过程
在motif_enrichment
之后,可视化的时候(pl.motif_enrichment
),出现报错
好,最直接的想法是直接搜一下,别人应该遇到过,然而,snapATAC2的GitHub上没有相关的,scipy的GitHub中也没有相关的……所以,看源代码……找到了heatmap
函数,然后通过数据定位到报错的那一行:
import plotly.figure_factory as ff
,使用plotly
中函数的时候出现了报错,直接到plotly的GitHub中搜索,在一个已经Closed的帖子中找到: