解决使用Plotly.py 中create_dendrogram 报错：AttributeError: Module ‘scipy‘ has no attribute ‘array‘

前言

日期：2024.2.2
最近在用snapATAC2分析scATAC数据的时候遇见的报错：AttributeError: Module ‘scipy’ has no attribute ‘array’，记录解决过程

过程

在motif_enrichment之后，可视化的时候（pl.motif_enrichment）,出现报错

好，最直接的想法是直接搜一下，别人应该遇到过，然而，snapATAC2的GitHub上没有相关的，scipy的GitHub中也没有相关的……所以，看源代码……找到了heatmap函数，然后通过数据定位到报错的那一行：

import plotly.figure_factory as ff，使用plotly中函数的时候出现了报错，直接到plotly的GitHub中搜索，在一个已经Closed的帖子中找到：
原因就是最新版的scipy遗弃了一些特征……

解决方案

安装旧版本scipy:

pip install scipy==1.11.4

然后就可以出图了：