【深度学习】基于STL10数据集构建 图像去噪自编码网络 的实验

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前言

本文主要参考孙玉林，余国本老师的《pytorch深度学习入门与实践》一书，跟着书上的代码学习相关原理理论，这本书真的写的非常好，让我明白了很多最基础的原理。本篇文章也是基于此书的笔记，加上了一些我自己的理解。
同时，书上的代码运行主要也是在CPU上运行的，所以我在这里换成了GPU运行，这样速度更快一些。
同时，我对书中的代码进行一些修改和探讨。

一、STL10数据集观察

首先书中提到要使用STL10数据集，通过以下命令进行下载：

import torch
from torchvision.datasets import STL10
data=STL10('data',download=True)

下载完成后data文件夹中数据如下：

压缩包数据为2.45GB，解压后为2.9GB。指的一提的是，这里所有bin都是二进制文件。二进制文件具体该如何操作我也不太清楚，（并且很多数据集文件类型都不太一样，有些是btype,有些又是二进制文件，到底它们分别应该如何操作后面找个时间好好把这些内容搞清楚咯）。
但是肯定的是，这里的bin文件必须要转为图像数据，在本书中也是定义了一个读取函数，用来进行数据转换。
下载的数据一共包括三部分，带标签的训练集，测试集，以及无标签的数据，大小都是96*96。按照本书的安排，我们只会使用到train_X.bin里的内容。
书里，定义的二进制文件转为图像文件的函数如下：

def read_image(path):
    with open(path,'rb') as f:
        data1=np.fromfile(f,dtype=np.uint8)
        images=np.reshape(data1,(-1,3,96,96))
        images=np.transpose(images,(0,3,2,1))
    return images/255.0

说实话我对python的文件操作还真不是特别懂，所以在看这段代码时显得有些力不从心。（甚至有些烦躁）
（1）首先rb是对二进制文件进行读操作
（2）其次是np.reshape操作（这个操作其实和torch.view()貌似有点点相像）
（3）然后是np.transpose操作，更改维度通道

最关键的是，为什么对bin文件，它要先用np.fromfile这个操作呢？：
我们点开np.fromfile这个函数：

后面查找了资料知道，np.fromfile函数是从文本或者二进制文件中读取并构造一个数组。我们来看看它构造的数组长啥子样子的：

import numpy as np
data_path='E:/图像处理课题/自编码器去噪网络/data/stl10_binary/train_X.bin'
with open(data_path,'rb') as f:
    data1 = np.fromfile(f, dtype=np.uint8)
    print(type(data1))
    print(data1.shape)

138240000，有点奇怪，像是一个一维数组。
紧接着我们看看接下来的操作，reshape重组数组的形状为(-1, 3, 96, 96)。
这个就很好理解了，相当于是把这个数据砍成n个3* 96 * 96的数据，这个3 * 96 *96就是一个三通道的照片，n=5000.(5000×3×96×96=138240000)：

后面这个维度变换说实话我也没看懂，本来b,c,h,w这个顺寻就是对的，为什么这里要把通道维度和高维度交换呢？这里我就先不管了，最后除了255，将像素值归一化到0-1之间（uint8的像素值范围值是0-255）

在完成二进制文件数据的转换之后，我们来看看数据包里面的图片都长啥子样子：

import torch
import numpy as np
from torchvision.datasets import STL10
import matplotlib.pyplot as plt

import os
os.environ["KMP_DUPLICATE_LIB_OK"]="TRUE"

data=STL10('data',download=False)
def read_image(path):
    with open(path,'rb') as f:
        data1=np.fromfile(f,dtype=np.uint8)
        images=np.reshape(data1,(-1,3,96,96))
        images=np.transpose(images,(0,3,2,1))
    return images/255.0
data_path='E:/图像处理课题/自编码器去噪网络/data/stl10_binary/train_X.bin'
images=read_image(data_path)  #最后输出的5000张图片
print(type(images)) #格式为<class 'numpy.ndarray'>
print("images.shape:",images.shape)
#print(images)
plt.figure(figsize=(6,6))
for i in range(36):
    plt.subplot(6,6,i+1)
    plt.imshow(images[i])
    plt.axis('off')
plt.show()

结果图片：

当然我们之前也提到了，我们用的照片只有5000张，并且这里plt.subplot也仅仅展示了36张，我们也可以调整参数，展示更多，且范围不一样的图片，例如下所示：

plt.figure(figsize=(9,9))
for i in range(81):
    plt.subplot(9,9,i+1)
    plt.imshow(images[i+1000])
    plt.axis('off')
plt.show()

这里展示了第1001到1081共81张照片。

二、噪声数据添加（噪声数据集生成）

目前来说，初始的（无污染的）数据集我们已经拿到，这时候我们还缺输入数据集（噪声数据集）。噪声数据集和无污染数据集（去噪数据集）合在一起，才能构成最终的数据集。

1.自定义噪声生成函数

在书中，给出了具体的噪声生成函数

def gaussian_noise(images,sigma):
    sigma2=sigma**2/(255**2)
    images_noise=np.zeros_like(images)
    for i in range(images.shape[0]):#images.shape[0]指原始数据集的数量，一共是5000张
        image=images[i]
        noise_im=random_noise(image,mode="gaussian",var=sigma2,clip=True)
        images_noise[i]=noise_im
    return images_noise

其实核心语句就那么一条：noise_im=random_noise(image,mode=“gaussian”,var=sigma2,clip=True)。使用的random_noise来生成噪声，当然出了高斯噪声，还有其他种类的噪声。
关于这条语句的具体使用方法，我也专门写了一篇博客介绍：random_noise

2.噪声图像展示

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三、数据切分，转换，加载

整体流程走下来就是：
step1.设置好X和Y（主要是交换维度，使得能够适应pytorch）
step2.X和Y切分为训练集和测试集
step3.ndarray数据形式转为张量形式
step4.X和Y合体（注意本题的Y是我们自己构造的，所以这里有一个合体的步骤，像mnist这种就不用）
step5.经典数据加载器，无需多言

## 数据准备为Pytorch可用的形式
## 转化为［样本，通道，高，宽］的数据形式
data_Y = np.transpose(images, (0, 3, 2, 1))
data_X = np.transpose(images_noise, (0, 3, 2, 1))
## 将数据集切分为训练集和验证集
X_train, X_val, y_train, y_val = train_test_split(data_X,data_Y,test_size = 0.2,random_state = 123)
## 将图像数据转化为向量数据
X_train = torch.tensor(X_train, dtype=torch.float32)
y_train = torch.tensor(y_train, dtype=torch.float32)
X_val = torch.tensor(X_val, dtype=torch.float32)
y_val = torch.tensor(y_val, dtype=torch.float32)
## 将X和Y转化为数据集合
train_data = Data.TensorDataset(X_train,y_train)
val_data = Data.TensorDataset(X_val,y_val)

train_loader = Data.DataLoader(
    dataset = train_data, ## 使用的数据集
    batch_size=8, # 批处理样本大小
    shuffle = True, # 每次迭代前打乱数据
    num_workers = 0, # 使用4个进程
)

## 定义一个数据加载器
val_loader = Data.DataLoader(
    dataset = val_data, ## 使用的数据集
    batch_size=8, # 批处理样本大小
    shuffle = True, # 每次迭代前打乱数据
    num_workers = 0, # 使用4个进程
)

四、自编码器网络搭建

书上用到的网络叫做基于卷积的降噪自编码器网络，关于自编码器网络，后续我也会自己出一个总结。
博客地址先放出来：
网络结构代码如下所示，就不具体赘述了，直接看代码就行（书上直接誊抄的）：
96 * 96 变为 24 * 24，，最后再恢复为96 * 96

class DenoiseAutoEncoder(nn.Module):
    def __init__(self):
        super(DenoiseAutoEncoder, self).__init__()
        ## 定义Encoder
        self.Encoder = nn.Sequential(
            nn.Conv2d(in_channels=3, out_channels=64,
                      kernel_size=3, stride=1, padding=1),  # [,64,96,96]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(64),
            nn.Conv2d(64, 64, 3, 1, 1),  # [,64,96,96]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(64),
            nn.Conv2d(64, 64, 3, 1, 1),  # [,64,96,96]
            nn.ReLU(),
            nn.MaxPool2d(2, 2),  # [,64,48,48]
            nn.BatchNorm2d(64),

            nn.Conv2d(64, 128, 3, 1, 1),  # [,128,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(128),
            nn.Conv2d(128, 128, 3, 1, 1),  # [,128,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(128),
            nn.Conv2d(128, 256, 3, 1, 1),  # [,256,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.MaxPool2d(2, 2),  # [,256,24,24]
            nn.BatchNorm2d(256),
        )
        ## 定义Decoder
        self.Decoder = nn.Sequential(
            nn.ConvTranspose2d(256, 128, 3, 1, 1),  # [,128,24,24]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(128),
            nn.ConvTranspose2d(128, 128, 3, 2, 1, 1),  # [,128,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(128),

            nn.ConvTranspose2d(128, 64, 3, 1, 1),  # [,64,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(64),
            nn.ConvTranspose2d(64, 32, 3, 1, 1),  # [,32,48,48]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(32),

            nn.ConvTranspose2d(32, 32, 3, 1, 1),  # [,32,48,48]
            nn.ConvTranspose2d(32, 16, 3, 2, 1, 1),  # [,16,96,96]
            nn.ReLU(),
            nn.BatchNorm2d(16),

            nn.ConvTranspose2d(16, 3, 3, 1, 1),  # [,3,96,96]
            nn.Sigmoid(),
        )

    ## 定义网络的向前传播路径
    def forward(self, x):
        encoder = self.Encoder(x)
        decoder = self.Decoder(encoder)
        return encoder, decoder

当然，我对 nn.BatchNorm2d(64),这个概念还不是很理解，后续也要出个博客总结一下。

五、训练

训练过程依然是比较经典的过程，两个for循环，对于epoch和batch:
相比于书上的代码 ，我还加上tqdm进度条

# 定义优化器
LR = 0.0003
optimizer = torch.optim.Adam(DAEmodel.parameters(), lr=LR)
loss_func = nn.MSELoss() # 损失函数
# 记录训练过程的指标
history1 = hl.History()
# 使用Canvas进行可视化
canvas1 = hl.Canvas()
train_num = 0
val_num = 0
## 对模型进行迭代训练,对所有的数据训练EPOCH轮
for epoch in range(10):
    train_loss_epoch = 0
    val_loss_epoch = 0
    ## 对训练数据的迭代器进行迭代计算
    loop1 = tqdm(enumerate(train_loader), total=len(train_loader) - 1)
    for step, (b_x, b_y) in loop1:
        b_x=b_x.to(device) #数据传到显卡上
        b_y = b_y.to(device)
        DAEmodel.train()
        ## 使用每个batch进行训练模型
        _, output = DAEmodel(b_x)  # CNN在训练batch上的输出
        loss = loss_func(output, b_y)  # 平方根误差
        optimizer.zero_grad()  # 每个迭代步的梯度初始化为0
        loss.backward()  # 损失的后向传播，计算梯度
        optimizer.step()  # 使用梯度进行优化
        train_loss_epoch += loss.item() * b_x.size(0)
        train_num = train_num + b_x.size(0)
        train_loss = train_loss_epoch / train_num
        loop1.set_description(f'Epoch [{epoch}/{10 - 1}]')
        loop1.set_postfix(train_loss = train_loss_epoch / train_num)

    loop2 = tqdm(enumerate(val_loader), total=len(val_loader) - 1)
    ## 使用每个batch进行验证模型
    for step, (b_x, b_y) in loop2:
        b_x = b_x.to(device) # 数据传到显卡上
        b_y = b_y.to(device)
        DAEmodel.eval()
        _, output = DAEmodel(b_x)  # CNN在训练batch上的输出
        loss = loss_func(output, b_y)  # 平方根误差
        val_loss_epoch += loss.item() * b_x.size(0)
        val_num = val_num + b_x.size(0)
    ## 计算一个epoch的损失

        val_loss = val_loss_epoch / val_num
        loop2.set_description(f'Epoch [{epoch}/{10 - 1}]')
        loop2.set_postfix(val_loss = val_loss_epoch / val_num)
    ## 保存每个epoch上的输出loss
    history1.log(epoch, train_loss=train_loss,
                 val_loss=val_loss)
    # 可视网络训练的过程
    with canvas1:
        canvas1.draw_plot([history1["train_loss"], history1["val_loss"]])

torch.save(DAEmodel,"E:/图像处理课题/自编码器去噪网络/DAEmodel_1.pkl")

训练进度条如下所示：

六、预测

本来是想单独写一个py文件进行预测，同时和训练过程分离开，结果没想到一直有问题（执行那段代码的时候，它直接跳转去之前的训练文件了）

代码就先直接抄了，后面有空了再来慢慢改

imageindex = 10
im = X_val[imageindex,...]
im = im.unsqueeze(0)
imnose = np.transpose(im.data.cpu().numpy(),(0,3,2,1))
imnose = imnose[0,...]
## 去噪
DAEmodel.eval()
im=im.to(device)
_,output = DAEmodel(im)
imde = np.transpose(output.data.cpu().numpy(),(0,3,2,1))
imde = imde[0,...]
## 输出
im = y_val[imageindex,...]
imor = im.unsqueeze(0)
imor = np.transpose(imor.data.cpu().numpy(),(0,3,2,1))
imor = imor[0,...]
## 计算去噪后的PSNR
print("加噪后的PSNR:",compare_psnr(imor,imnose),"dB")
print("去噪后的PSNR:",compare_psnr(imor,imde),"dB")

## 将图像可视化
plt.figure(figsize=(12,4))
plt.subplot(1,3,1)
plt.imshow(imor)
plt.axis("off")
plt.title("Origin image")
plt.subplot(1,3,2)
plt.imshow(imnose)
plt.axis("off")
plt.title("Noise image $\sigma$=30")
plt.subplot(1,3,3)
plt.imshow(imde)
plt.axis("off")
plt.title("Deoise image")
plt.show()

结果：

七、小重点：如果要调用GPU，必须在哪些位置加to(device)（.cuda()也行）

仅仅以本题为例
1.首先声明设备

device = torch.device("cuda:0" if torch.cuda.is_available() else "cpu") #调用cpu或者cuda

2.网络实例化时

DAEmodel = DenoiseAutoEncoder().to(device)

3.对每一个batch进行训练时候的X，y数据（有噪图，无噪图），也需要导入到显卡中

。。。。。。。。。
loop1 = tqdm(enumerate(train_loader), total=len(train_loader) - 1)
    for step, (b_x, b_y) in loop1:
        b_x=b_x.to(device) #数据传到显卡上
        b_y = b_y.to(device)
        DAEmodel.train()
        。。。。。。。。。。。

。。。。。。。。。
 loop2 = tqdm(enumerate(val_loader), total=len(val_loader) - 1)
    ## 使用每个batch进行验证模型
    for step, (b_x, b_y) in loop2:
        b_x = b_x.to(device) # 数据传到显卡上
        b_y = b_y.to(device)
        DAEmodel.eval()
        。。。。。。。。。。。

八、小重点：tqdm进度条使用

tdqm主要是在对每一个batch进行训练时使用的
原本应该张这个样子

for step, (b_x,b_y) in enumerate(train_loader): 

改进后长这样：

loop1 = tqdm(enumerate(train_loader), total=len(train_loader) - 1)
    for step, (b_x, b_y) in loop1:
        。。。。。。。。。。。。。。。。
        loop1.set_description(f'Epoch [{epoch}/{10 - 1}]')
        loop1.set_postfix(train_loss = train_loss_epoch / train_num)

同理，对验证集也是这样

loop2 = tqdm(enumerate(val_loader), total=len(val_loader) - 1)
    ## 使用每个batch进行验证模型
    for step, (b_x, b_y) in loop2:
        。。。。。
        loop2.set_description(f'Epoch [{epoch}/{10 - 1}]')
        loop2.set_postfix(val_loss = val_loss_epoch / val_num)

九、代码bug调试总结

1.OMP: Error #15: Initializing libiomp5md.dll, but found libiomp5md.dll already initialized问题

这个问题遇到很多次了，一般我直接加两条语句就解决了：

import os
os.environ["KMP_DUPLICATE_LIB_OK"]="TRUE"

2.页面文件太小

报错时代码如下：

train_loader = Data.DataLoader(
    dataset = train_data, ## 使用的数据集
    batch_size=8, # 批处理样本大小
    shuffle = True, # 每次迭代前打乱数据
    num_workers = 4, # 使用4个进程
)

报错界面如下所示：

这个问题还是比较经典的，就是内存不足的问题：
一般来说，我就把num_workers变成0就不会出现这样的问题

3.RuntimeError: Input type (torch.FloatTensor) and weight type (torch.cuda.FloatTensor) should be the

解决方法如4一样

4.RuntimeError: Expected all tensors to be on the same device, but found at least two devices, cuda:0 and cpu!

和3一样，这种报错，多半就是数据，网络等配置没有放在同一个地方（必须都在CPU上，或者都在GPU上）。
这个报错的原因多半就是哪里漏写了to(device)

5.RuntimeError: Unable to find a valid cuDNN algorithm to run convolution

这种报错主要原因是因为batch_size设置过大了（但是我报错那次设的是16，这都大？？？），改小点就可以了

6.can’t convert cuda:0 device type tensor to numpy. Use Tensor.cpu() to copy the tensor to host memory first.

这个问题的产生原因是：之前网络训练时候，数据转换为了Tensor张量，并且全部放到了GPU上进行训练，所以这会要在CPU上使用numpy形式进行预测的时候，需要把设备转移到CPU上来。解决方法也很简单，以下为例：
原本报错的代码：

imde = np.transpose(output.data.numpy(),(0,3,2,1))

修改后不报错的代码：

imde = np.transpose(output.data.cpu().numpy(),(0,3,2,1))