医疗图像深度学习——打开DICOM文件的RT STRUCT 标记图像并转化为图片

本文介绍了如何使用Python和3D Slicer处理The Cancer Imaging Archive的医疗图像数据集,特别是如何打开和查看RT STRUCT标记图像,并通过dcmrtstruct2nii工具将其转化为图片。
摘要由CSDN通过智能技术生成

近日需要用到The Cancer Imaging Archived的医疗图像数据集,这里简单记录一下自己的一些经验

1.下载数据集

数据集链接:

https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/Lung+CT+Segmentation+Challenge+2017

下载数据集首先要下载NBIA Data Retriever,就是这个东西

安装过程我忘记了,总之装上之后,再下载他数据集里的tcia文件,打开,点击start就可以下载了

2. 3D Slicer查看RT struct 

下载下来发现标记文件也是一个dcm格式的文件,查找资料发现是RT Struct格式的标记文件。

在处理之前我想先看一下图像,这里我使用了3D Slicer,打开后把dicom文件夹和RTStruct格式的标记文件夹都拖进去

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