linux中使用awk根据多个列名提取指定列数据

linux中使用awk根据多个列名提取指定列数据

首先需要准备一个只包含列名的文件name.list
和你要从中提取列的文件data.txt

name.list
a1
a2
a3
a4

data.txt
a0  a1  a2  a3  a4  a5  a6  b1  b2  b7  b8  b19
1   2   3   3   3   3   3   4   5   5   6   7  
1   2   3   1   3   3   3   2   5   1   6   7  
1   2   3   3   3   1   3   4   5   5   6   1  
1   2   3   3   8   3   4   3   5   5   1   7  
... 

提取的文件，第一行为列名，与name.list对应，默认输出第一列（a0列）

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}NR==FNR{a[NR]=$1}NR>FNR&&FNR==1{tar="$1";for(i=1;i<length(a)+1;i++){for(j=1;j<NF+1;j++){if(a[i]==$j){tar=tar",$"j}}}cmd="awk '\''BEGIN{FS=OFS=\"\\t\"}{print "tar"}'\'' " ARGV[2];system(cmd)}'  name.list  data.txt

不输出第一列（a0列）

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}NR==FNR{a[NR]=$1}NR>FNR&&FNR==1{for(i=1;i<length(a)+1;i++){for(j=1;j<NF+1;j++){if(a[i]==$j){if(tar == ""){tar="$"j}else{tar=tar",$"j}}}}cmd="awk '\''BEGIN{FS=OFS=\"\\t\"}{print "tar"}'\'' " ARGV[2];system(cmd)}'   name.list  data.txt