- 博客(16)
- 问答 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 python报错logsumexp
解决ImportError: cannot import name ‘imread’ from ‘scipy.misc’(Anaconda3\lib\site-packages\scipy\misc）或者ImportError: cannot import name 'comb’以及 'logsumexp’的解决方式直接进去改genisim包里面的代码，但最好不要乱改。原因是 scipy.misc包里面更新后没有logsumexp了，作者我是改了genisim里面的一条代码：将ldamodel.py
2022-03-24 18:06:44
3595
2
翻译 DBNLDA: Deep Belief Network based representation learning for lncRNA-disease association prediction
文献实验复现——DBNLDA一、准备数据集二、构建网络1.构建网络，运行代码——Network_creation.ipynb三、模型学习——DBN_learning.ipynb四、模型分类——NNClassifier-CV.ipynb总结文章目录一、准备数据集二、构建网络1.构建网络，运行代码——Network_creation.ipynb三、模型学习——DBN_learning.ipynb四、模型分类——NNClassifier-CV.ipynb总结提示：这里可以添加本文要记录的大概内容：例如：
2022-01-22 00:28:39
616
2
原创 tensorflow报错
如果使用的是tensorflow1的版本直接引用import tensorflow as tf*就可以。如果使用tensorflow2的版本引用格式：*import tensorflow._api.v2.compat.v1 as tftf.disable_v2_behavior()tensorflow v2版为解决与v1版兼容问题，用compat.v1。 你用v1版，把compat.v1删掉就可以了。...
2021-11-04 10:28:21
360
翻译 富集分析——疾病与基因 DOSE包使用
DOSE包（Disease Ontology Semantic and Enrichment analysis ）实现了Resnik、Schlicker、Jiang、Lin和Wang分别提出的五种度量DO语义相似度的方法和用于富集分析的超几何检验1. 查询两个基因簇之间的语义相似性clusterSim(cluster1, cluster2, measure = “Wang”, combine = “BMA”)Examplescluster1 <- c(“835”, “5261”,“241”,
2021-10-30 21:45:43
2918
原创 安装clusterProfiler包
source(“https://bioconductor.org/biocLite.R”)biocLite(“DOSE”)biocLite(“topGO”)biocLite(“clusterProfiler”)biocLite(“pathview”)一、 bioconductor包安装##将上面安装方法转为以下步骤安装R包BiocManager::install(“DOSE”)BiocManager::install(“topGO”)BiocManager::install(“pathvi
2021-10-30 20:15:25
4480
1
原创 CTDquerier
R包CTDquerier不能这么安装：install.packages(“CTDquerier”)正确安装方法：BiocManager::install(“CTDquerier”)补充：install.packages(“knitr”)library(CTDquerier)library( knitr )
2021-10-28 18:46:24
91
原创 source(“https://bioconductor.org/biocLite.R“)报错
运行source(“https://bioconductor.org/biocLite.R”)biocLite(“apeglm”)报错：错误: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; see https://bioconductor.org/install原因：R 3.6以后使用BoicManager进行依赖管理先运行以下代码安装BioManager即可。if (!requir
2021-10-12 12:10:25
4735
原创 Linux/Ubuntu下安装配置anaconda
**安装配置anaconda简洁版步骤：**1. wget命令下载wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh2 .安装命令chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shsh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh3.配置conda的环境变量vi ~/.bashrcexport PATH="/home/ax/m
2021-09-12 17:22:26
357
原创 2021-07-16
**面向对象——封装、多继承、继承、多态**‘’’多继承‘’’class A(object):def test_a1(self):print(“A——类test_a1方法”)def test_a2(self):print(“A——类test_a2方法”)class B(object):def test_b1(self):print(“B——类test_b1方法”)def test_b2(self):print(“B——类test_b2方法”)class C(A,B):A.t
2021-07-16 21:53:08
71
原创 自然辨证法练习1
1.毛泽东科技创新思想的根本立足点是( )自力更生2.马克思主义自然观形成的重要标志和核心是( )辩证唯物主义自然观3、技术异化的根源在于技术本身4.科技给人类社会带来的风险源自( )科学技术的本身5.钱学森把科学技术认识过程,按照从实践到理论的发展过程,划分为三个层次,哪一个不是( )...
2021-03-11 18:44:37
760
原创 Pycharm 安装第三方包，显示安装成功，但是没有包显示
Pycharm 安装第三方包（requests…)显示安装成功，但是没有包显示无论是用pip安装包还是在文件→设置→python interpreter里面安装包均显示安装成功，但是依然没有包显示——解决方法：以folium包为例：第一步：清除缓存并重启；第二步：重新打开文件——设置，重新再安装一遍；第三步：即安装成功。即可使用此包！...
2021-02-17 22:41:50
2349
翻译 Ubuntu：Package has no installation candidate
问题：# apt-get install Reading package lists… DoneBuilding dependency tree… DonePackage aptitude is not available, but is referred to by another package.This may mean that the package is missing, has been obsoleted, oris only available from another sou
2021-02-10 19:45:24
304
原创 ubuntu忘记/找回root密码
1、在powershell控制台下执行ubuntu config --default-user root2、打开Ubuntu控制台，执行passwd输入新密码3、再进入powershell控制台下执行ubuntu config --default-user 用户名最后，进入Ubuntu控制台，找回成功。...
2021-02-10 18:17:10
1499
1
原创 R语言报错：没有“left_join“这个函数 没有“column_to_rownames“这个函数
简单快速解决办法：1、在rstudio上package里面搜magrittr, 应该是没打勾调用这个包,打上勾就好了2、输入代码加载包：library(dplyr)ok拉。
2021-02-08 13:42:04
11773
2
原创 Linux报错：rm: cannot remove ‘****‘: Is a directory
rm: cannot remove ‘xxx’: Is a directory表示这个文件是无法remove移除的，因此我们不能仅使用rm来将这个文件夹进行删除，需要使用:rm -rf 文件名
2021-01-30 08:41:25
11085
原创 生物信息学——文献阅读
HPOLabeler improving prediction of human protein-phenotype associations by learning to rank阅读笔记**Xiaodi Huang Charles Sturt University · School of Computing and MathematicsLizhi Liu Fudan University · School of Computer Science从以下四个方面解说本文：problem d.
2021-01-15 21:42:59
1059
3
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人