运行
source(“https://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite(“apeglm”)报错:
错误: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; see https://bioconductor.org/install
原因:R 3.6以后使用BoicManager进行依赖管理
先运行以下代码安装BioManager即可。
if (!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = TRUE))
install.packages(“BiocManager”)
使用以下代码安装R包
BiocManager::install(“apeglm”)
要安装什么依赖直接BiocManager::install(“xxx”)即可