Gephi插件安装

安装插件的必要性

导入Gephi包含node和edge颜色属性,按理说之后导入Gephi,按照Phylum(微生物的门水平)对node进行着色就行了,但是如果跑多个图的话,就会发现每次不同的Phylum对应的颜色都不一样,故需要安装插件来固定颜色,使其每次都对应上导入文件中的颜色,

安装give colors to nodes在这里插入图片描述

在线安装

点击[工具]—>[插件]—>[可用插件]
搜索give colors to nodes并安装
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本地安装

由于网络问题安装失败,需要自行去官网下载安装
去官网下载网址:https://gephi.org/plugins/#/
选择合适的版本
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点击[工具]—>[插件]—>[已下载]—>[添加插件]
选择本地下载好的givecolortonodes-1.0.0.nbm进行安装
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同理安装Give Colors To Edges
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安装成功:
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Gephi 是一种开源的网络可视化工具,它允许用户通过交互式方式探索和分析网络数据。Gephi 提供了一个件系统,允许用户通过编写件来扩展其功能。Python 是一种流行的编程语言,它具有丰富的科学计算库和网络分析工具。因此,可以使用 Python 编写 Gephi 件来扩展 Gephi 的功能。 要使用 Python 开发 Gephi 件,需要下载 Gephi 工具和 Gephi Toolkit。Gephi Toolkit 是一个 Java 库,允许用户使用 Java 或 Python 来访问 Gephi 的功能。使用 Python 开发 Gephi 件的步骤如下: 1. 安装 Gephi 工具和 Gephi Toolkit。 2. 使用 Python 编写件代码。可以使用 Gephi Toolkit 提供的 Python API,来访问 Gephi 的功能。 3. 将代码打包成 jar 文件,以便在 Gephi 中加载。 4. 在 Gephi 中加载件并运行。 下面是一个使用 Python 开发 Gephi 件的示例,该件将网络数据保存为 CSV 文件: ```python from org.gephi.io.exporter.plugin import ExporterCSV from org.openide.util import Lookup exporter = Lookup.getDefault().lookup(ExporterCSV) exporter.setWorkspace(workspace) exporter.setExportVisible(True) exporter.setExportEdges(True) exporter.setExportNodes(True) exporter.setExportEdgeLabels(True) exporter.setExportNodeLabels(True) exporter.setExportType(ExporterCSV.ExportFileType.NODES_EDGES) exporter.setWorkspace(workspace) exporter.execute(NullProgressTicket()) ``` 这个示例使用 Gephi Toolkit 提供的 ExporterCSV 类来导出网络数据。在这个示例中,我们设置了导出选项,例如导出可见节点和边缘,以及将节点和边缘标签导出为 CSV 文件。最后,我们调用 execute() 方法来执行导出操作。 需要注意的是,Gephi Toolkit 提供了丰富的 API,可以用来访问 Gephi 的各种功能。因此,使用 Python 开发 Gephi 件的难度并不高,只需要掌握基本的 Python 编程知识和 Gephi Toolkit 的 API。

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