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RSS订阅转载 edgeR文库均一化详细过程
第一步：移除所有未转录的基因 以下面的虚拟测序数据为例，在这批数据中，有3个样本，每个样本有5个基因，如下所示：可以看到，Gene5在这3个样本中的reads数都是0，因此要把Gene 5去掉，如下所示：第二步：选择参考样本 我们需要在这组样本中，挑选出一个样本作为“参考样本”，然后使用这个样本来均一化其他的样本。如果在一个样本中只有一个基因的read数大于0，其他基因的read全是0，选择这个样本作为“参考样本”，会导致所有基因的reads数的均一化都只是...
2021-12-16 16:45:45
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原创 【R】SCDE包的代码报错问题
利用scde包，运行官网的例子，在构建和计算模型时：# EVALUATION NOT NEEDED# calculate modelso.ifm <- scde.error.models(counts = cd, groups = sg, n.cores = 1, threshold.segmentation = TRUE, save.crossfit.plots = FALSE, save.model.plots = FALSE, verbose = 1)出现以下错误：erro.
2021-10-24 16:50:56
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空空如也
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