vtk图像处理
5.1vtk图像创建
5.1.1vtk图像数据结构
数字图像文件内容有两个部分组成:图像头信息和数据。
图像头信息包括起点位置(Origin)、像素间隔(Space)和维数(Dimension)。这三个参数即可确定图像空间位置和大小。图像可看作空间中的一个规则的网格,网格中的每个最小单元称为像素(二维)或体素(三维),网格在每个方向上的像素或者体素个数即为图像在该方向上的维数。
下图表示一个4 $ \times $ 2 $ \times $ 3的体素的图像,即图像的位数,每个小球表示一个像素。图像原点为(5.1,10.0,6.5),两个像素之间的间隔表示像素间隔,每个方向上的像素间隔分别为1.5、1.5和1.8。
图像数据既为图像像素的像素值,一般采用一维数组来表示和存储。已知像素索引和图像维数的情况下,即可计算每个像素对应的像素值。医学图像中经常使用灰度图像。灰度图像的像素或体素中不需要考虑,其默认范围是0~255,可以采用一个unsigned char类型来表示。医学图像的会不范围要大于255,一般的范围为0~65536
5.1.2vtk图像创建
1.图像源Source
vtk中内置了多个创建图像的Source类,利用这些Source类可以快速创建图像。例如,用vtkImageCanvasSource2D为代表。该Source类的功能是创建画布,并提供多种几何图形的绘制填充功能。
vtkSmartPointer<vtkImageCanvasSource2D> canvas =
vtkSmartPointer<vtkImageCanvasSource2D>::New();//定义一个vtkImageCanvasSource2D对象
canvas->SetScalarTypeToUnsignedChar();
canvas->SetNumberOfScalarComponents(1);
canvas->SetExtent(0, 100, 0, 100, 0, 0);
canvas->SetDrawColor(0, 0, 0, 0);
canvas->FillBox(0,100,0,100);//绘制矩形
canvas->SetDrawColor(255, 0, 0, 0);//设置矩形颜色
canvas->FillBox(20,40,20,40);
canvas->Update();
// Create actors
vtkSmartPointer<vtkImageActor> redActor =
vtkSmartPointer<vtkImageActor>::New();
redActor->SetInputData(canvas->GetOutput());
// Define viewport ranges
// (xmin, ymin, xmax, ymax)
double redViewport[4] = { 0.0, 0.0, 1.0, 1.0 };
// Setup renderers
vtkSmartPointer<vtkRenderer> redRenderer =
vtkSmartPointer<vtkRenderer>::New();
redRenderer->SetViewport(redViewport);
redRenderer->AddActor(redActor);
redRenderer->ResetCamera();
redRenderer->SetBackground(1.0, 1.0, 1.0);
// Setup render window
vtkSmartPointer<vtkRenderWindow> renderWindow =
vtkSmartPointer<vtkRenderWindow>::New();
renderWindow->AddRenderer(redRenderer);
renderWindow->SetSize(640, 480);
renderWindow->Render();
renderWindow->SetWindowName("ImageCanvasSource2D");
// Setup render window interactor
vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> renderWindowInteractor =
vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();
vtkSmartPointer<vtkInteractorStyleImage> style =
vtkSmartPointer<vtkInteractorStyleImage>::New();
renderWindowInteractor->SetInteractorStyle(style);
// Render and start interaction
renderWindowInteractor->SetRenderWindow(renderWindow);
renderWindowInteractor->Initialize();
renderWindowInteractor->Start();
return EXIT_SUCCESS;
效果:
其他vtk快速生成特定图像:
vtk类 | 功能 |
---|---|
vtkImageEllipsoidSource | 根据指定中心以及各个轴的半径来生成一个前景为椭圆的二值图像 |
vtkImageGuassianSource | 生成一幅像素值服从高斯分布的图像 |
vtkImageGridSource | 生成网格线图像 |
vtkImageNoiseSource | 生成一个像素值为随机数的噪声图像 |
vtkImageSinusoidSource | 生成图像像素值由正弦函数决定 |
5.2vtk图像显示
5.2.1vtkImageViewer2
vtkImageViewer2中封装了vtk图像显示的可视化渲染引擎。该类提供的主要交互操作有图像放缩、窗宽窗位调节,并提供切片选择及方向设置接口,尤其适合三维图像的切片显示。
vtkSmartPointer<vtkMetaImageReader> reader =
vtkSmartPointer<vtkMetaImageReader>::New();
reader->SetFileName(argv[1]);
reader->Update();
vtkSmartPointer<vtkImageViewer2> imageViewer =
vtkSmartPointer<vtkImageViewer2>::New();
imageViewer->SetInputConnection(reader->GetOutputPort());
vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> renderWindowInteractor =
vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();
imageViewer->SetupInteractor(renderWindowInteractor);
imageViewer->SetColorLevel(500);
imageViewer->SetColorWindow(2000);
imageViewer->SetSlice(40);
imageViewer->SetSliceOrientationToXY();
imageViewer->Render();
imageViewer->GetRenderer()->SetBackground(1.0, 1.0, 1.0);
imageViewer->SetSize(640, 480);
imageViewer->GetRenderWindow()->SetWindowName("DisplayImageExample");
renderWindowInteractor->Start();
效果:
1.窗宽、窗位的概念
窗宽是图像显示的灰度范围。一般显示器的灰度范围为256级,而医学图像的灰度范围则远大于该范围,因此显示器不能显示所有灰度级,需要使用窗宽来定义欲现实的灰度范围。当灰度值高于该范围的最大值,均以白影显示。当低于该范围时,均以黑色显示。
2.医学图像二维视图
切片或切面时三维图像比较常见的概念,不同方向的切面都有特定的名字,分别是:矢状面,沿着身体前后径所做的与地面垂直的切面;冠状面,沿着身体左右径做的与地面垂直的切面;横断面,是指横断身体与地面平行的切面。
5.2.2 vtkImageActor
vtkImageActor是一个三维图像渲染Actor,通过纹理映射将图像映射到多边形上进行显示。
5.2.3 图像融合
使用vtkImageBlend实现两个图像融合:
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader> reader = vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>::New();
reader->SetFileName("E:\\PeopleImage\\wallhaven-newke8.jpg");
reader->Update();
vtkSmartPointer<vtkImageCanvasSource2D> imageSource = vtkSmartPointer<vtkImageCanvasSource2D>::New();
imageSource->SetNumberOfScalarComponents(1);
imageSource->SetScalarTypeToUnsignedChar();
imageSource->SetExtent(0,512,0,512,0,0);
imageSource->SetDrawColor(0.0);
imageSource->FillBox(0, 512, 0, 512);
imageSource->SetDrawColor(255.0);
imageSource->FillBox(100, 400, 100, 400);
imageSource->Update();
vtkSmartPointer<vtkImageBlend> imageBlend = vtkSmartPointer<vtkImageBlend>::New();
imageBlend->SetInputData(0, reader->GetOutput());
imageBlend->SetInputData(1, imageSource->GetOutput());
imageBlend->SetOpacity(0, 0.4);
imageBlend->SetOpacity(1, 0.6);
imageBlend->Update();
效果:
5.3 vtk图像基本操作
5.3.1图像信息的访问与修改
1.利用vtkImageData的方法
vtkSmartPointer<vtkJPEGReader> reader = vtkSmartPointer<vtkJPEGReader>::New();
reader->SetFileName("E:\\PeopleImage\\wallhaven-newke8.jpg");
reader->Update();
int dims[3];
reader->GetOutput()->GetDimensions(dims);
std::cout << "图像维数" << dims[0] << " " << dims[1] << " " << dims[2] << std::endl;
double origin[3];
reader->GetOutput()->GetOrigin(origin);
std::cout << "图像原点" << origin[0] << " " << origin[1] << " " << origin[2] << std::endl;
double spaceing[3];
reader->GetOutput()->GetSpacing(spaceing);
std::cout << "像素间隔:" << spaceing[0] << " " << spaceing[1] << " " << spaceing[2] << std::endl;