生物信息与遗传医学前沿AI网站平台概览二

基因组变异分析与注释工具

1遗传病数据解读工具InterVar立足于生物信息学领域,主要功能是根据ACMG/AMP指南提供遗传变异的自动临床解释。
2基因组注释工具annovar专注于遗传学领域,主要提供基因组变异的注释和功能预测
3基因组变异分析与注释工具varCards2用于快速查询和解释遗传变异,提供详细的变异注释和临床相关信息
4基因组可视化工具UCSC Genome Browser提供基因组数据的可视化展示和分析工具
5基因组注释与比较工具Ensembl一个基因组浏览器,提供基因组数据的集合,包括基因注释和序列信息
6预测工具Ensembl Variant Effect Predictor (VEP)用于预测基因组变异对蛋白质编码的影响,提供详细的功能注释
7基因组变异预测工具FATHMM预测遗传变异对蛋白质功能的影响,特别是错义变异
8表型-基因关联分析工具Phenolyzer用于表型-基因关联分析的工具,帮助研究者识别可能与特定表型相关的基因
9基因表达分析工具Gene Expression Omnibus (GEO)一个公共的基因表达数据集资源,支持数据的提交、存储和检索
10基因组编辑工具CRISPR Design Tools一系列工具用于设计CRISPR/Cas9基因组编辑实验,包括目标位点选择和编辑效率预测

生物医学文献与数据分析平台

11生物医学文献资源网站pubtator立足于生物医学文本挖掘,主要功能是自动化地从PubMed摘要中提取生物学信息
12挖掘基因型-表型关系的工具GPDminer专注于基因-表型数据分析,主要功能是识别疾病相关的基因和生物标志物

遗传变异工具

13ClinVar一个公共数据库,提供遗传变异的临床意义注释
14dbSNP一个公共数据库,收录单核苷酸多态性(SNPs)和小型插入/缺失
15 HaploReg提供关于人类基因组中遗传多态性及其对基因表达和调控影响的信息
16 RegulomeDB提供关于非编码区域的功能注释,特别是那些可能影响基因表达调控的区域
171000 Genomes Project一个大规模的公共数据库,包含来自世界各地的人类遗传变异数据

其他生物信息学工具

18致病性预测工具PolyPhen-2立足于生物信息学,主要功能是预测人类基因组中氨基酸替换对蛋白质功能的影响
19致病性预测工具MutationTaster提供关于遗传变异的致病性预测
20预测氨基酸替换对蛋白质功能的影响工具SIFT专注于预测变异对蛋白质功能的影响,主要功能是评估氨基酸替换的致病性
21自动变异位点分类或预测工具AutoPVS1立足于临床遗传学,主要功能是自动化地为PVS1(Pathogenicity Very Strong)标准的解释提供支持
22序列比对工具BLAST作为生物信息学的核心工具,主要功能是通过序列相似性搜索帮助识别和分析生物序列
23蛋白质结构预测工具Phyre2用于蛋白质三维结构的预测,基于已知结构的同源建模

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