R语言与作物模型实践应用

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随着基于过程的作物生长模型（Process-based Crop Growth Simulation Model）的发展，R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对作物模型相关知识之外，还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程，被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土碳循环、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。R语言在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备，自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。因此，为辅助提高作物模型工作者的使用DSSAT模型的技术，我们举办了本次R语言与作物模型高级应用实战技术培训班，让大家不需要使用界面操作就可以快速批量运行DSSAT模型，方便各个领域可以更好地交叉融合、扩展应用。我们精选大量作物模型应用案例，九大专题（独孤九剑），全程干货，熟悉R语言编程技术和DSSAT这一综合型农业生态系统模型，提高学员模型应用能力、数据分析和图表制作技能。如果你是资深模型爱好者，可以进一步了解各个模块的相关算法；如果你是个模型入门者，让你体验一键模拟的乐趣。

1、原理深入浅出的讲解；

2、技巧方法讲解，提供所有案例数据及代码；

3、与项目案例相结合讲解实现方法，对接实际工作应用 ；

4、跟学上机操作、独立完成案例操作练习、全程问题跟踪解析；

5、 专属助学群辅助巩固学习及实际工作应用交流，不定期召开线上答疑。

专题一DSSAT模型的高级应用

1.作物模型的概念

2.DSSAT模型发展现状

3.DSSAT与R语言的安装与介绍

4.DSSAT模型的高级应用案例

5.R语言在作物模型参数优化中的应用

6.R语言在作物模型全球栅格模拟中的应用

7.R语言在作物模型结果分析和数据可视化中的应用

专题二R语言与数据科学

1 R语言与数据科学

1)R语言发展脉络

2)R语言数据操作技巧

3)R语言在作物模型中的应用

2 R语言编程技巧数据操作

1)R与工作目录

2)R的数据类型及结构

3)R中各数据类型的赋值与操作

4)各种数据格式的读写及操作

专题三DSSAT模型高级应用技巧

1 DSSAT模型操作

1)DSSAT的安装

2)DSSAT模型操作界面讲解

2 DSSAT模型源码操作与编译

1）DSSAT模型源码安装

2）DSSAT源码的介绍与修改

3）DSSAT源码的编译

专题四R语言准备DSSAT气象文件

1 DSSAT自带的气象数据的准备

2 R语言操作和准备气象文件

1）DSSAT气象文件的介绍

2）日照转辐射算法的编写

3）DSSAT气象文件的编写

专题五R语言准备DSSAT土壤文件

1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数

2 DSSAT模型土壤水分-氮素-有机碳模块的主要算法

3 DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算

4 使用R语言操作和准备土壤输入文件

5 DSSAT模型全球土壤数据库的使用

专题六R语言准备DSSAT管理文件

1 DSSAT模型的农田管理措施（播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等）的介绍

2 使用R语言进行管理文件批量准备（只需要填写excel，就能批量模拟）

专题七R语言准备DSSAT参数文件及批量模拟文件

1 DSSAT模型的主要遗传参数，包括物种参数、生态型参数、品种参数

2 主要的参数优化方法

3 使用R语言进行参数文件准备

4 使用R语言对批量模拟文件的编写

专题八R语言对模拟结果进行数据清洗和整理

1 使用R语言读取DSSAT文件的模拟结果

2 对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

专题九R语言对模拟结果进行数据分析及绘图

1 使用R语言对模拟结果进行分析

2 使用R语言计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值

3 使用R语言对模拟结果进行可视化（模拟结果的动态图和1：1图等）

附加

• 根据科研或生产实际，提供数据，集体讨论DSSAT的高级应用方案

• 提供若干附加材料，包括典型论文、其它软件以及学习材料

• 实例回顾、训练、巩固

• 答疑与讨论