生信
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Griffy650
这个作者很懒,什么都没留下…
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GWAS:使用R,比较GLM和MLM对假阳性的控制差异(复刻Nature genetics 图)
我们来复刻如下这张2016年发表在Nature genetics上的一篇文章中比较GLM和MLM的QQ plot!et al.ZmVPP1Nat Genet数据是随便找的,成果图基本上就是这种样式。原创 2022-12-08 23:11:46 · 1050 阅读 · 0 评论 -
Prokka:从安装到使用的那些坑!!!
报错1:mamba install...: File not valid : file size doesn't match expectation。报错2:RuntimeError: Multi-download failed。采取上文作者推荐的直接使用conda安装,按照作者的代码将模块加入环境即可。,就在github上搜到了解决方法,即。,这里创建名为prokka的小环境,,我用mamba总是出现报错TUT。解决方法:安装Bioperl。解决方法:别纠结了,原创 2022-09-06 20:57:50 · 3766 阅读 · 0 评论 -
系统变量没有Path,Java环境设置?Java环境设置完成,但Cytoscape仍然闪退?
目录1.系统变量没有path,Java环境设置?2.Java环境设置完成,但Cytoscape仍然闪退?3.安装过程(大致过程含资源分享)1.系统变量没有path,Java环境设置?本人win10系统,看网上好多说Java环境设置是要在系统变量的Path那里新建,添加Java的安装路径,但是我的系统变量没有Path这个变量值,看到网上有人说win10的系统变量和用户变量的Path合在一起了,于是我的解决方法:Java环境变量设置:①在用户变量的Path新建,添加Java安装路原创 2022-04-26 08:46:57 · 2286 阅读 · 2 评论 -
关于Perl哈希嵌套数组的总结,如何向数组中添加元素
今天对哈希嵌套数组进行了一些摸索,这里跟大家分享一下我的摸索成果!博主也是perl的小白,总结有很多不完善的地方,希望各路大神多多指正,感谢!!!成果只有两句话:$hash{$key}=[@array];就可以把数组传递给哈希了$hash{$key}[position];就可以访问哈希里嵌套的数组的元素了,这里的position就是指要访问第几个元素(从0开始的)下面是一些可能对uu们有用的解说1.把数组的元素传递给哈希可行方法:$hash{$key}=[@array];#这原创 2021-10-26 18:46:37 · 2526 阅读 · 4 评论 -
第一次尝试N50计算,走进生信的第一步
作为个人学习记录,也分享给有需要的uu们!本来是学习Perl的课堂作业,还是尝试了一下换成python,但是python确实没有Perl处理的速度快。小蟒蛇输给大骆驼了 QAQ写的过程也超级曲折,不断修改完善代码,熬了个大夜!(小白哭哭)##Author:Griffy##Date:2021-10-21##Version1:①使用正则,没必要用;②不能够巧妙地使用字典,如何同时遍历字典的键和值##Version2:①改正了对基因组的理解;②边读文件边处理速度更快(处理大文本的正确方法)原创 2021-10-22 00:03:32 · 1937 阅读 · 2 评论