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原创 rMATS使用及报错解决
conda安装rMATS,python2.7环境会报错,建议python3.6。如果已经出现过报错,修改完文件路径后,find命令后得到的txt文件。报错重点:更改txt文件格式(首先需要构建样本组位置文件。
2024-01-24 07:01:59 539
原创 1.1IsoformSwitchAnalyzeR安装
mamba是用于管理环境的 CLI 工具,相比于conda 对包和环境的管理,mamba可以实现并行运算。相比于 conda,mamba 是用C++重写了 conda 的部分功能,conda环境太多,硬是花了两天时间才成功安装上。给大家分享我的踩坑历史,希望大家开启快乐的转录本分析流程。至此IsoformSwitchAnalyzeR包安装完成,后面的文章会对此R包的应用进行一些经验分享。简单来说呢,r-base需要4.2及以上(python>=3.6)。1.1conda构建py3.6的环境。
2023-12-11 07:32:50 379 1
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