R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggforest函数可视化等比例风险模型的森林图（cox forest plot）

最新推荐文章于 2024-10-25 16:47:05 发布
最新推荐文章于 2024-10-25 16:47:05 发布
阅读量304 收藏
点赞数
CC 4.0 BY-SA版权
分类专栏： ggplot2及其扩展包可视化实战系列（持续更新） 文章标签： r语言 人工智能 数据挖掘 数据分析
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_57242009/article/details/128049689
本文介绍了R语言survival包的survfit函数如何拟合生存曲线数据，以及survminer包的ggforest函数如何用于可视化等比例风险模型的森林图。生存分析在临床研究中常见，用于处理考虑时间的二分类结局。survminer包提供多种生存曲线的可视化功能，帮助用户更好地理解和展示生存数据。

R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggforest函数可视化等比例风险模型的森林图（cox forest plot）

目录

R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggforest函数可视化等比例风险模型的森林图（cox forest plot）

 导入包和库

 R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggforest函数可视化等比例风险模型的森林图（cox forest plot）

生存分析就是一种数据分析的统计流程，它的结果变量(outcome variable)关注的是直到事件发生的时间(time until an event occurs)。

时间(Time)，指的是从一个人随访开始到关注的事件发生所经历的数年、数月、数周或数天。另一种解释是个体在事件发生时的年龄。

su

了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
R语言survminer包的ggsurvplot函数可视化生存曲线、使用arrange_ggsurvplots函数将多个生存曲线图（表）组合起来、ggsave保存到pdf文件中
statistics+insight+vista+power
10-28 1775
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot函数可视化生存曲线、使用arrange_ggsurvplots函数将多个生存曲线图（表）组合起来、ggsave保存到pdf文件中
使用R语言中的survminer包中的ggsurvevents函数可视化生存时间分布图
2301_79331328的博客
08-29 154
在上述代码中，我们首先创建了一个Surv对象，其中"time"是生存时间的变量，"event"是事件发生情况的变量。在该函数中，我们指定了"data"参数为我们的数据集，"timepoint"参数为时间点100，表示我们希望在该时间点绘制生存时间分布图。在生存分析中，可视化生存时间分布图是一种常见的方法，它可以帮助我们直观地了解事件发生的时间和概率分布。通过使用survminer包中的ggsurvevents函数，我们可以方便地绘制生存时间分布图，以帮助我们更好地理解事件发生的时间和概率分布。
R语言 生存分析
热门推荐
KopWelkin的博客
05-04 1万+
生存分析处理预测特定事件将要发生的时间。 它也被称为故障时间分析或分析死亡时间。 例如，预测患有癌症的人将存活的天数或预测机械系统将失败的时间。 命名为survival的R语言包用于进行生存分析。 此包包含函数Surv（），它将输入数据作为R语言公式，并在选择的变量中创建一个生存对象用于分析。 然后我们使用函数survfit()创建一个分析图。 安装软件包 install.packa...
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggcompetingrisks函数可视化竞争风险累积事件曲线
statistics+insight+vista+power
11-26 868
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggcompetingrisks函数可视化竞争风险累积事件曲线
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot_facet函数绘制生存曲线分面图（facet.by指定单个分面变量、分面变量为分组变量）
statistics+insight+vista+power
11-26 406
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据（模型中指定两个分组变量）、survminer包的ggsurvplot_facet函数绘制生存曲线分面图（facet.by指定单个分面变量、分面变量为分组变量）
R语言机器学习算法实战系列（十三）随机森林生存分析构建预后模型 (Random Survival Forest)
专注生信领域
10-25 1357
本教程运用随机森林生存分析筛选与患者生存状态显著相关特征。该方法借随机森林这一强大机器学习算法，构建多棵决策树并集成结果，以提高生存分析准确性，识别关键生物标志物。接着，利用选定特征构建风险得分，将多个特征转化为单一数值，量化患者风险水平。之后，依据风险得分将患者分为高、低风险亚型，为临床治疗提供个性化指导。最后，通过分析时间依赖的 ROC 曲线评估模型长期预测能力。此曲线计算不同阈值下的真正例率与假正例率，在多个时间点评估，全面展现模型长期稳定性与准确性。
python cox模型_Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
weixin_39610188的博客
02-09 2367
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。之前分享过绘制KM曲线R|生存分析(1)，诺莫图展示COX结果Nomogram(诺莫图) | Logis...
Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
weixin_39556044的博客
10-08 1万+
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。 Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。 ​ 之前分享过绘制KM曲线R|生存分析（1），诺莫图展示COX结果Nomogram（诺莫...
在 R 语言中使用 survfit 函数来获取不同水平下的生存信息是非常常见的任务
PixelLoom的博客
08-29 997
survfit 函数是生存分析中的重要工具，用于计算生存曲线和生存概率。通过增加一个因子变量，我们可以根据该变量的不同水平来比较不同组别之间的生存情况。为了实现这个目标，我们首先需要加载适当的 R 包，例如 survival 包，它提供了用于生存分析的函数和数据集。我们还需要一个包含生存时间和事件信息的数据集，以及一个表示因子变量的列。总结起来，通过在 survfit 函数中添加一个因子变量，我们可以获得该变量不同水平下的生存信息。变量的不同水平进行生存分析。，我们可以查看每个组别的生存曲线和生存概率。
R语言使用survival包生存分析、在survfit函数中设置公式不包含自变量、使用summary函数获取寿命表：包含了各个时间点存活对象的个数、生存率及其置信区间等信息
statistics+insight+vista+power
05-27 623
R语言使用survival包的Surv函数创建生存对象、在survfit函数中设置公式不包含自变量、使用summary函数获取寿命表：包含了各个时间点存活对象的个数、生存率及其置信区间等信息
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot函数可视化生存曲线、xlim参数指定X轴的时间刻度范围、xlab参数指定X轴的标签信息
statistics+insight+vista+power
11-03 257
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot函数可视化生存曲线、xlim参数指定X轴的时间刻度范围、xlab参数指定X轴的标签信息
在R语言中使用`surv.median.line`参数为分层生存曲线添加中位生存时间标记
2301_79331387的博客
08-28 470
在生存分析中，分层生存曲线是一种常用的可视化工具，用于比较不同群体或处理组之间的生存情况。而中位生存时间是一个重要的生存指标，表示在该时间点上，一半的个体已经发生了事件（如死亡）。参数为分层生存曲线添加中位生存时间的标记。这对于生存分析中的结果展示和比较非常有用，可以帮助研究人员更好地理解不同群体之间的生存差异。参数来为分层生存曲线添加中位生存时间的标记。，我们为分层生存曲线添加了中位生存时间的标记。通过运行上述代码，我们可以得到一个包含分层生存曲线和中位生存时间标记的图形输出。函数进行生存曲线的绘制。
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot_list函数一次性绘制多个模型的生存曲线
statistics+insight+vista+power
12-30 274
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggsurvplot_list函数一次性绘制多个模型的生存曲线
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的surv_summary函数获取生存曲线的summary信息
statistics+insight+vista+power
01-10 364
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的surv_summary函数获取生存曲线的summary信息
R语言生存分析、在survfit函数设置公式不包含自变量、使用summary函数获取寿命表：包含了各个时间点存活对象的个数、生存率、置信区间、自定义设置包含删失信息
statistics+insight+vista+power
05-29 861
R语言使用survival包的Surv函数创建生存对象、在survfit函数中设置公式不包含自变量、使用summary函数获取寿命表：包含了各个时间点存活对象的个数、生存率及其置信区间等信息、自定义设置包含删失统计信息
R语言survminer包的ggcoxdiagnostics函数诊断cox等比例风险模型、检查对结果产生影响的异常样本值或离群值、type参数指定显示在Y轴的残差类型
statistics+insight+vista+power
12-04 197
R语言survival包的survfit函数拟合生存曲线数据、survminer包的ggcoxdiagnostics函数诊断cox等比例风险模型、检查对结果产生影响的异常样本值或离群值、type参数指定显示在Y轴的残差类型
R语言survival包Surv函数创建生存对象、survfit函数设置公式不包含自变量、使用plot函数可视化生存曲线（Kaplan-Meier法估计的生存率）、设置参数为删失数据添加标记
statistics+insight+vista+power
05-07 1924
R语言使用survival包的Surv函数创建生存对象、在survfit函数中设置公式不包含自变量、使用plot函数可视化生存曲线（Kaplan-Meier法估计的生存率是一个阶梯状的函数）、设置参数为删失数据添加标记
ggsurvplot图片输出
ToyPython的博客
06-23 9858
ggsurvplot图片输出 gg <- ggsurvplot( … ) ggsave(“name.tiff”), plot = print(gg), width = 18, height = 8.5, units = “in”) 注意一定要加上plot = print§
cox比例风险模型r语言
最新发布
03-08
### 使用R语言实现Cox比例风险模型 #### Cox比例风险模型简介 生存分析是一种用于分析时间至事件发生的数据的统计方法，广泛应用于医学、生物学和社会科学等领域。Cox比例风险模型是生存分析中常用的一种模型，它...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

statistics.insight

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值