真菌转录组组装方法(有参)与Gene Prediction Commend 01略有不同
4)index得到:MS2_hisat2re.sam MS2_hisat2re.summaryview得到:MS2_hisat2re.bamsortindexfalgstate对回帖bam质量评估只分析已知转录本组装和定量得到:ballgown_out_dir cov_refs.gtf gene_abund.tab本质上,stringTie只提供了转录本水平的表达量,定量方式包括TPM和FPKM值两种。prepDE.py 需要一个 sample_list,第一列为样本名,第二列为。
原创
2023-04-19 10:43:27 ·
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