SiR-Maleimide,Silicon Rhodamine硅基罗丹明-马来酰亚胺活性细胞荧光成像分析

罗丹明由于其优异的光物理特性和生物相容性被广泛应用3。同时，其存在无发射的闭环形式和发光的开环形式间的可逆反应（图1a）。该反应的平衡常数可通过在氧杂蒽环上进行不同的修饰来进行调整，相应的参数可描述为∆GC-O、pKcycl。由于该平衡的存在，罗丹明染料可实现自发闪烁并用于超分辨成像。然而，将螺环反应平衡移动至极窄的自发闪烁窗口需经过大量实验试错。

近来，发展了一种用于简单、快速、准确预测罗丹明染料自发闪烁性质的方法（图1）。

罗丹明开闭环结构之间存在的热力学平衡使其具有自发闪烁的性质。基于此，作者猜测闭环形式和开环形式的吉布斯自由能差（∆GC-O）可作为一种用以预测罗丹明自发闪烁能力的算符。∆GC-O越大，更少的罗丹明以有荧光的开环形式存在。因此，当∆GC-O略大于0时，少数的罗丹明以开环形式存在，其与闭环形式的罗丹明具有自发且可逆的热力学平衡，从而诱导罗丹明on/off状态的切换。虽然实验中很难准确测得∆GC-O，但该参数可以经过简单的DFT计算得到。

 同时，pKcycl即吸光度降低至一半时的pH值，大pKcycl值意味着生理条件下（pH 7.4）罗丹明可保持开环形式。作者以Urano课题组报道的25种羟甲基罗丹明（U1-U25）作为模型，试图将∆GC-O（理论计算）和pKcycl（实验）联系起来，发现两参数之间具有良好的线性关系(r2 = 0.965)（图2a-b）。经过简单的基态吉布斯自由能的计算可以成功的预测罗丹明的pKcycl值，绝对误差仅有0.30。同时，以阳离子和两性离子为开环结构模型均可得到良好的线性关系（图2b）。

在之前的工作中，Urano提出pKcycl ≤ 6.0时羟甲基罗丹明可作为优良的指示剂。基于上述的分析，作者进一步提出当pKcycl ≥ 5.3时，羟甲基罗丹明可在近中性环境下实现自发闪烁。由于理论计算和实验所得的pKcycl值存在0.3的平均误差，理论计算所得的阈值应为[5.0, 6.3]，对应的∆GC-O范围应为[1.156, 1.248 eV]。至此，通过对分子进行简单的理论计算即可确定∆GC-O是否落在理想的范围内，从而快速的设计自发闪烁的罗丹明染料。

 

 

 SiR-alkyne    硅基罗丹明-炔基
SiR-azide    硅基罗丹明-叠氮
SiR-BCN    硅基罗丹明-环丙烷环辛炔
SiR-COOH    硅基罗丹明-羧基
SiR-Maleimide    硅基罗丹明-马来酰亚胺
SiR-NHS ester    硅基罗丹明-琥珀酰亚胺酯
SiR-tetrazine    硅基罗丹明-四嗪
SiR-Me-tetrazine    硅罗丹明-四嗪荧光探针
SiR-DBCO    硅基罗丹明-二苯基环辛炔
SiR650-BG    硅基罗丹明-苄基鸟嘌呤
SiR700-BG    硅基罗丹明-苄基鸟嘌呤
SiR-PEG3-TCO    硅基罗丹明-三聚乙二醇-反式环辛烯
SiR-PEG4-alkyne    硅基罗丹明-四聚乙二醇-炔基
SiR-PEG4-azide    硅基罗丹明-四聚乙二醇-叠氮
SiR-PEG4-BCN    硅基罗丹明-四聚乙二醇-环丙烷环辛炔
SiR-PEG4-COOH    硅基罗丹明-四聚乙二醇-羧基
SiR-PEG4-Maleimide    硅基罗丹明-四聚乙二醇-马来酰亚胺
SiR-PEG4-NHS ester    硅基罗丹明-四聚乙二醇-琥珀酰亚胺酯
SiR-PEG4-tetrazine    硅基罗丹明-四聚乙二醇-四嗪
SiR-PEG4-DBCO    硅基罗丹明-四聚乙二醇-二苯基环辛炔

齐岳小编：axc