awk实践 （按列求和、求均值、统计次数）

awk按列求和

得到列数a的方法很多，例如awk 'NR==1{print NF}' test.txt 
a=列数
for ((i=1;i<a;i++));do awk 'BEGIN{sum=0}{sum+='"$i"'}END{print sum}';done

awk按列求平均值

for ((i=1;i<a;i++));do awk 'BEGIN{sum=0}{sum+='"$i"'}END{print sum/'"$a"'}';done

R中也是可以实现求和、平均值 

可以使用R中的apply函数是实现也是可以的
apply(dat, 2, sum)
apply(dat, 2, mean)

 awk统计次数，按列统计行（条件）出现的次数

#统计每列中大于0的行的个数，即每个样本中ASV的个数table_filtered.xls文件中行名为ASV，列名为样品
for ((i=2;i<=a;i++));do awk -v i=$i 'BEGIN{b=0}$i>0{b++}END{print b }' table_filtered.xls;done