颠倒的海德格尔-CSDN博客

原创 SIFTS 数据库挖掘

sifts URL选择

2026-04-15 09:38:57 41

原创记1次 log 优化

uniprot以及pdb数据库爬取，高并发场景，log逻辑优化

2026-04-15 09:18:09 350

原创如何对长度超过限制的蛋白质序列做ESM-2 embedding？

蛋白质语言模型的一些经典问题

2026-04-09 14:54:28 421

原创 Python日志模块logging 配置

python日志管理模块

2026-04-09 11:10:22 16

原创 RCSB PDB数据库挖掘-1

PDB数据库挖掘一试

2026-04-07 14:31:38 454 1

原创文献速览: Unstructured transcription factor interactions enable emergent specificity

文献速览（一开始设置这个栏目的目的是为了倒逼自己看文献，现在想想，应该是倒逼自己看公众号，但是看也不能白看，至少记录一下）

2026-04-02 10:01:13 62 1

原创 PPT汇报中方法学、框架流程图的文生图方案1

科研汇报，非coding部分总结图的快速生成方案

2026-04-01 10:39:23 397

原创机器学习中的固定随机种子方案

机器学习中的可复现性相关调研

2026-03-30 10:58:19 413

原创不平衡模型性能分析

类别不平衡model的metric作弊

2026-03-26 15:57:02 382

原创如何获取1个uniprot 蛋白质的所有PDB结构

PDB id的转换获取

2026-03-24 09:52:24 436

原创 Zerotier-Tailscale 自动化监控

之前使用的一些廉价的内网穿透的云服务容易崩，干脆写一个监控脚本能够自己重连

2026-03-23 15:47:56 492

原创 Claw生态部署1

Arkclaw以及Rokid上接入部署

2026-03-23 14:02:08 946

原创 HTTP协议 —— uniprot数据库挖掘应用实例

本意是挖掘uniprot数据库元数据时的一些新想法，趁着这个机会将http先粗略理解一遍

2026-03-12 11:30:58 422

原创 python解析XML格式数据

python解析处理数据库xml格式内容

2026-03-10 14:14:03 412

原创 rokid 眼镜安装第三方安卓app

AI硬件具体在实际中如何赋能日常生活

2026-03-06 10:35:13 346 1

原创本地部署ColabFold, 实现蛋白质结构预测全自由

部署alphafold2

2026-02-12 21:50:06 865 1

原创 Chap2 Neural Networks with PyTorch

这篇博客也积压了很久，大概是一月初，快半个月的东西，其实衔接chap1的话，本系列已经完全足够让新手开始尝试用pytorch生态的逻辑以及神经网络建模的视角去审视他自己感兴趣的模型架构了，可以说入门科普的目的基本上已经达到了

2026-01-23 20:14:14 749

原创如何为我们的GPU设备选择合适的CUDA版本和Torch版本？

炼丹环境配置前

2026-01-08 11:24:22 2225 5

原创 Chap1-1 Numpy手搓神经网络—入门PyTorch

本篇正式跨越numpy到pytorch，从理论到工程化组织，神经网络在我们眼里应该不那么神秘了，

2026-01-07 15:13:22 557

原创深度学习model权重文件

model权重文件

2026-01-06 10:40:40 983

原创 Chap1：Neural Networks with NumPy（手搓神经网络理解原理）

新开一个专栏，也是深度学习的，但是我会focus在蛋白质模型里，从alphafold一路讲到IDPfold之类

2026-01-05 22:43:25 1104

原创矩阵微积分速通

机器学习中涉及到矩阵的微积分运算，所有会用到的一些基础的求导知识

2026-01-02 22:50:43 789

原创临时图表快速生成

背景icon生成

2025-12-25 21:24:50 201

原创 nvidia-smi输出界面

nvidia显卡查看信息基本命令

2025-12-24 15:12:02 663

原创 vscode的colab扩展目前的一些问题

colab扩展的一些问题

2025-12-23 16:33:38 1284

原创什么是 API（应用程序编程接口）？

纯扫盲贴

2025-12-23 14:59:50 924

原创在vscode中使用colab的GPU算力

之前一直都是民间大神的野路子，现在官方也下场了

2025-12-23 09:04:14 1253

原创 GitHub代码搜索——工具&技巧

github搜索

2025-12-21 22:31:37 1163 1

原创记1次BioPython Entrez模块Elink的debug

debug还是学到了不少

2025-12-19 23:20:26 626

原创文献阅读自动化1-批量检索、更新文献

pubmed自动化第1篇

2025-12-13 16:59:42 1162

原创计算解析并可视化Alphafold3结构预测结果

我开发的一个af3以及更一般的mmcif结构文件可视化小工具

2025-12-11 18:43:54 1413

原创如何为你的Python项目构建pyproject.toml文件

基本上现在大部分github的python开发项目，都有pyproject.toml配置

2025-12-11 16:38:27 377

原创代码知识库平台的构建：如何解构可视化代码并快速上手？

一些小总结，关于如何找代码+如何读懂代码，在AI时代基本都有了一些自动化的解决方案，对于cs+x的AI4S科研人员来说，是真正赶上了一个好时代

2025-12-05 22:30:18 1143

原创 LibInspector—为小白智能解析、阅读（几乎所有）Python工具库

一个智能解析Python工具库的工具，生成新手友好的阅读文档

2025-12-02 22:25:53 795

原创 Yazi —— 推荐一款终端文件管理器

一个linux终端TUI文件管理工具

2025-12-02 15:30:45 784

原创设置Zsh为默认Shell

默认zsh

2025-12-02 14:51:23 276

原创 Alphafold3一些置信指标的再解读

2个问题

2025-11-24 11:41:56 1295 1

原创 Alphafold实用指南—官网教程3

EBI alphafold培训最后内容

2025-11-22 21:45:36 1310 1

原创 Alphafold实用指南—官网教程2

EBI alphafold培训系列2

2025-11-22 16:11:47 1533

原创 AlphaFold实用指南—官网教程1

EBI关于alphafold的官网教程指南

2025-11-20 18:14:42 1065

空空如也

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